Submitted by wangkangcheng on Sat, 11/24/2012 - 19:32
老师好,我刚刚接触functional connectivity density(FCD),看了一些文章,FCD有global functional connectivity density(gFCD)、local functional connectivity density(LFCD)、long-range functional connectivity density(long-range FCD)想问一下,rest1.8中,得到的结果是那个值?LFCD和臧老师提出的ReHo有什么区别?谢谢
Submitted by ZangYF on Sat, 11/24/2012 - 21:39 Permalink
Re: 请问做FCD时,该软件计算的是gFCD还是LFCD?
Tomasi & Volkow (2010 PNAS)这篇文章我没有非常仔细读。local FCD大致相当于在给定的局部团块内计算两两相关系数,然后取r=0.6为阈值,然后计算每个体素与团块内其它体素有“连接”的个数。而global FCD大致是计算全脑每两个体素的两两相关,然后计算每个体素在全脑中有“连接”的个数。我估计local FCD估计应该与ReHo很接近。而long-range FCD可能就是global FCD中去除local FCD的部分,也就是说,反映了某个体素与全脑较远的所有的体素的功能连接数目。REST 1.8提供的功能,我不是很了解。
Submitted by wangkangcheng on Sat, 11/24/2012 - 22:07 Permalink
Re: 请问做FCD时,该软件计算的是gFCD还是LFCD?
谢谢臧老师!其他老师可以再补充一下rest1.8版本中计算的是哪个吗?
Submitted by YAN Chao-Gan on Tue, 11/27/2012 - 05:20 Permalink
Re: 请问做FCD时,该软件计算的是gFCD还是LFCD?
你好!
算法同Zuo et al., 2012,与gFCD类似。
Zuo, X.N., Ehmke, R., Mennes, M., Imperati, D., Castellanos, F.X., Sporns, O., Milham, M.P., 2012. Network Centrality in the Human Functional Connectome. Cereb Cortex 22, 1862-1875.
会分别生成二值化网络的degree centrality和加权网络的degree centrality。
请参考一下http://restfmri.net/ forum/course 新的第三部分,有比较详细的介绍。III. Multimedia Course: Data Processing of Resting-State fMRI
Submitted by wangkangcheng on Tue, 11/27/2012 - 09:00 Permalink
Re: 请问做FCD时,该软件计算的是gFCD还是LFCD?
谢谢老师!