Submitted by wujingxi on Wed, 12/26/2012 - 01:29
老师好:
我用GE机器扫描静息态180个VOLUMES(80个TR),然后要将DICOM文件导成NIFTI格式文件,导完后发现,生成文件是82对,除了需要的80对*.hdr/img文件外,还有一个*.bvec和一个*.bval文件,据我所知,用记事本打开*.bval文件,发现里面是180个1000,据我所知,这两个文件是DTI像时的文件,但是,我们这是RESTING像。
然后我们查了倒出来的图像质量,没有问题。
请问这是为什么呢?会不会影响后续处理?
Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 12/29/2012 - 07:26 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
我猜想你的这个文件夹下的数据是DTI文件,而非EPI文件。最好仔细确认。
Submitted by wujingxi on Sat, 12/29/2012 - 09:53 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
应经确认了 是静息文件 (DTI和静息的层数不一样,文件大小不一样)
但是 还是没有解决最初的问题 为什么会出现这2个文件
Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 01/04/2013 - 05:26 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
奇怪,如果是EPI像,不应该转出这两个文件的。转的时候确认这个文件夹下没有其他文件?
Submitted by wujingxi on Sat, 01/05/2013 - 20:57 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
文件夹下只有resting像
不知道怎么回事儿 有没有什么办法能人工验证图像是否正确呢?
Submitted by ZangYF on Sun, 01/06/2013 - 23:43 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
确认的方法包括:扫描了多长时间,对应有多少时间点(你只扫描了80个volume? TR多长?即使是TR = 3s,只有4分钟?总时间与volume数目能否完全对应?);列一下文件大小,BOLD的3D图像,通常比较小,并且应该基本一致(多数情况下,大小应该完全一致)。另外,用什么软件转的?生成的这两个文件分别多大?
Submitted by wujingxi on Mon, 01/07/2013 - 21:22 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
严老师:
谢谢答复 我核对了一下
1.80仅仅是举例而已,应该是180TR,TR=2s.总时间和VOLUME完全对应
2.*.hdr/img大小在300K左右,文件大小都一致,任何人之间也一致,和我们以前的经验基本吻合;
3.用dcm2nii转的
我还查了一下,*.bvec文件里面都是0
谢谢
Submitted by ZangYF on Wed, 01/09/2013 - 17:41 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
这的确是个很奇怪的事。或许GE头信息里有其它内容?不过,既然不影响结果,就先不管它吧。我们用的GE 750数据,好像没发现这个问题。
Submitted by wujingxi on Wed, 01/09/2013 - 20:20 Permalink
Re: GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件
恩 谢谢