请教一个关于重采样的问题

Submitted by duxue on Wed, 01/09/2013 - 10:22

 请问当我们想用Rest软件进行重采样的时候，这个软件默认的精度是多少啊？（1*1*1还是3*3*3啊？）在进行重采样的时候，有没有一个原则是只能从精度高的往低的重采样，不能把低的往高地采啊？我们现在想将VBM结果进行Alphasim矫正，当用slice viewer打开我们的结果时会出来一个警告提示我们进行重采样，而我们的结构数据在扫描时是1*1*1，当进行预处理进行配准时变成了1.5*1.5*1.5,所以最后的结果应该是1.5*1.5*1.5的，这样的话我们重采样需要采成多少呢？谢谢老师~~~

Submitted by YAN Chao-Gan on Sun, 01/13/2013 - 11:51

当你想使用REST来进行重采样的时候，你一定是想采样成某种目标精度，所以默认的精度是没有意义的。从高到低，或者从低到高的插值都是可以的。但从3*3*3重采样为1*1*1，多出来的那些信息是用算法插出来的，并不是原来的真实信息。
另外，你重采样的目的是什么呢？

Submitted by duxue on Sun, 01/13/2013 - 12:51

 谢谢老师的回答，是这样的，我想对结果进行Alphasim校正，所以利用rest里面那个模拟Alphasim进行计算，同时想把VBM计算得到的灰质作为mask放进来，但灰质mask的精度是1.5*1.5*1.5，不清楚这样直接计算有没有问题，另外，因为用slice viewer打开我们的结果时就老是出来提示我们重采样，所以不清楚slice viewer默认的精度是多少，这样我才能将自己的结果采成同样精度。不知道我这样做有没有问题呢？谢谢老师

Submitted by YAN Chao-Gan on Sun, 01/13/2013 - 13:02

这种情况下，采样成1.5即可。

那个提示是因为要显示的图像中含有旋转矩阵，你的图像normalize到MNI空间了吗？一般带旋转矩阵的图像用MRIcroN查看。

Submitted by duxue on Sun, 01/13/2013 - 16:09

 哦，原来是这样啊，谢谢老师，我的图像在预处理过程中确实是已经标准化到MNI空间了，所以这种图像不适合在slice viewer里面看是吧？因为slice viewer也是基于xjview设计的，那这样的话能适合用xjview吗？谢谢老师

Submitted by admin on Sun, 01/13/2013 - 21:07

 一点小更正，我写SliceViewer是基于或者模仿MRIcro，不是xjView，我最初的目的也是为了方便大家能在MATLAB平台下用程序来控制或者自定义显示。另外，xjView与SliceViewer确实有部分交集，因为都是用来看图的。

Submitted by duxue on Sun, 01/13/2013 - 21:43

非常谢谢老师~~那xjview和sclice viewer二者在使用上有什么特殊情况吗？比如就像之前老师说的含有旋转矩阵的用slice viewer看就会有警告出来，这种情况是不是就不适合用它来看结果（或者用slice viewer看结果结果之前应该将这样的图像重采样？）除此以外，在使用它时还有什么需要注意的吗？谢谢老师~~~