rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢？

Submitted by flyinghonghong on Mon, 01/21/2013 - 17:01

各位老师好：
     我已经用rest处理得到了配对t检验的t-map文件，格式是”.nii”，然后用Slice View可以读取，也可以看cluster。但是我想看每个cluster里面除了peak点以外的t值比较大的点的坐标和t值，请问要怎么才可以得到这样的t值和坐标的table呢？？？？

Submitted by ZangYF on Fri, 01/25/2013 - 07:29

 我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是，如何定义“t值比较大的几个体素”。或者，你猜测一个大的cluster内，可能有多个小的cluster，这样，就会出现多个“亚”peak？如果是这个问题，倒是有一些方法，但大家并不是很关注。比如，你或许可以试试提高阈值，看能否将cluster分开。在AFNI中，有一些方法，比如，如果两个cluster相连，可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法，但我不知道哪个软件支持这个功能。