请教臧老师和严老师关于DARTEL方法进行VBM分析以及slice viewer和xjview不一致的问题

Submitted by will on Fri, 01/25/2013 - 23:05

 臧老师，严老师：
        您们好！我想请教您们几个问题：
       1、我使用DPARSFA里的new segement and DARTEL的方法做了一下VBM分析，除了性别、年龄，我还想把全脑体积的影响作为协变量去除掉，但是应该使用原始空间的c1还是使用wc1或者mwc1作为协变量呢？
       2、在文章里想介绍患者组和对照组灰质、白质、脑脊液、脑总体积之间有无统计学差异，应该使用原始空间的还是标准化之后的体积呢？（比如灰质，是使用c1、 wc1 还是mwc1）？我看有的文献里是比较的 normalized volume，这里我肤浅的理解似乎使用原始空间分割出来的灰白质、脑脊液体积做统计比较更为合适，不知道对不对？
       3、对于VBM的结果可否使用AlphaSim校正？因为我的结果显示的区域比较好，但是却经不起FDR校正。
       4、使用slice viewer和xjview看结果，使用 AlphaSim 校正，在slice viewer里p值取0.01（cluster size=506）恰恰和xjview里p值取0.005（cluster size=350）是一样的，所以我迷惑了，p值都不一样了，在文章里，应该交代使用哪种方法比较好呢？
        问题有点多，很抱歉！祝您们身体健康，工作顺利！
                                                                                                                                                                                             一个对脑研究还没入门的学生
                                                                                                                                                                                                       2013-1-25

Submitted by ZangYF on Sun, 01/27/2013 - 22:52

1、我对modulated之后的volume一直不太理解。
2、如果不是modulated，标准化之后再比较两组之间的灰质、白质或者CSF的总体积是可以的。比较原始空间的总体积也是可以的，但三种成分的原始空间的体积，明显受大脑总体积的影响。
3、可以。
4、xjview可能使用的是SPM的统计结果，这个统计是单边检测，是错误的。这个问题，可以查找本网站以前的交流。

Submitted by ANDY_NSMC on Sun, 11/24/2013 - 12:29

    您好，我也是使用DPARSF分割出来的灰白质等，由于是初学者不懂怎么来统计。下面几个问题想请教：
    1、这样处理出来的数据是不是已经经过标准化过的。
    2、还需要什么样软件，进行什么样的步骤统计或者把您的出来过程分享一下。
    希望不吝赐教， 谢谢！

Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 01/30/2013 - 02:03

你好！补充一点我的理解：

1. 我记得VBM toolbox是把原始空间中的c1, c2, c3累加起来计算全脑体积的，可以采用这样的办法来得到全脑体积。然后以此得到的一列数值做为协变量。
2. 如果只是比较总体积，或某种组织的体积，我赞成采用原始空间的图像计算会好一些。但是，如果要涉及到voxel水平的组统计，则还是需要在标准空间来进行，才能保证体素之间的对应性。