求助VMHC的一个问题

大家好,最近我打算用rest试着跑VMHC,出现以下问题:

我直接打开rest的,然后输入数据目录,提示没数据。
我不知道做VHMC需要哪步的数据,我试过这些目录的数据,都提示no data:
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFiltered
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

应该选择哪一步的数据呢?

谢谢

VMHC原理与功能连接(seed based correlation)差不多。所以两者应该用相似的预处理。即FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

如果你是选择上面的总文件夹的话,需要点右键“Add recursively all sub-folders of a directory”来添加。

 您好!
我对VMHC也感兴趣,读了几篇文献发现都是基于FSL/Alfani做的,我们的新版Deparsf是否能够全程跑完。
1)跑到FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved,是否表示预处理完成了。接下来再选择“Normalize  to symmetric template” 和“VMHC”即可?
2)新版里“Normalize derivative” 和“smooth derivative” 是用来干什么的,要选择吗?
3)文献里VMHC的统计比较似乎也和我们平时用的不一样,能够用rest里面的FDR/Montcarlo矫正吗
谢谢!


Hi,

1. 预处理步骤是完成了,这是一种比较常见的方式,当然争议还是存在。如果你是用basic edition处理的,然后再advanced edition做normalize to symmetric template,不一定能正确地找到文件,但你可以试试。

2. normalize derivative是在原始空间计算之后,把计算出来的指标(如ALFF)配到MNI空间。smooth同理。

3. 我认为在一侧MASK里面是可以的。

严老师好,这两天用DPARSF计算VMHC老是报错,看过了视频和论坛,还是没有找到答案,希望得到您的指导!

1.怕是数据有问题,我跑了两遍,每次都到computing VMHC出现问题,说File doesn't exist: F:\my_fmri_data_hangzhou\123\FunImgARglobalCWFsymS\pat_001_A_01.nii.gz(两次说的不存在的被试对象还不一样),报错的红字我附在附件txt中,自己查看了下,这个文件夹中,pat_001不像其他被试,他是单独的一个文件,其他的都有文件夹,感觉他就像没被处理一样
2.Results中有两个文件夹,VMHC_FunImgARCWFsymS 和 VMHC_FunImgARglobalCWFsymS ,我该看哪一个呢?具体的含义是什么?

Error | Forum of resting-state fMRI

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