计算头动的translation和rotation

Submitted by fish on Sun, 04/07/2013 - 11:01

在头动校正中，网上有spm的公式找每个大脑头动的最大值，在dparsf中，会有文件自动显示根据标准的不同而剔除的大脑。那么我想问然后算这些头动的平均值，还有translation和rotation。谢谢各位老师

Submitted by fish on Thu, 04/11/2013 - 00:52

不好意思,我说的有点乱.有人在spm中计算头动最大值用的是b=load('rp_name.txt');c=max(abs(b));c(4:6)=c(4:6)*180/pi这样一个简单的小公式。在dparsf中会自动见到分类好的头动数据，见fig1。我想问fig2（有关头动的均值和标准差的计算）是否有像类似spm的计算公式，或者其他更简单的？谢谢各位老师

Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 04/12/2013 - 05:25

把max改成mean。

不过，现在报告这已经不流行了。

再起流行报告FD, 尤其是FD jenkinson，可参考：

Yan, C.G., Cheung, B., Kelly, C., Colcombe, S., Craddock, R.C., Di Martino, A., Li, Q., Zuo, X.N., Castellanos, F.X., Milham, M.P., 2013. A comprehensive assessment of regional variation in the impact of head micromovements on functional connectomics. Neuroimage 76, 183-201.

FD Power或FD Jenkinson，DPARSF都会自动生成。FSL也新出了一个函数，见：http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FSLMotionOutliers