VMHC图像问题

Submitted by wleewell on Wed, 04/17/2013 - 14:37

论坛老师好！
我在DPARSFA2.2版中跑出来的VMHC图像好奇怪，脑中缝很亮（估计是自相关相关值特别高），而大脑双侧全是灰色阴影（VMHC图像请见附件）。这个问题可以怎么解决呢？中缝处置零？
预处理步骤为：
Slice timing

Motion-corrected

spatially normalized, then resampled to 3 mm isotropic voxels.

linear detrend AND filtering (0.01-0.08 Hz).

nuisance signals involving six head motion parameters, global mean signal, cerebrospinal fluid signal, and white matter signal were regressed out.

VMHC computation

AttachmentSize
Binary Data zVMHCMap_sub_002a.nii1.04 MB

Submitted by wleewell on Fri, 04/19/2013 - 20:17

谢谢！
如果不置零，还是用DPARSFA出来的图像，进行统计分析，结果会有影响吗？
如果有，怎么置为零呢？我是学医的不会编程序，这个复杂吗？如果简单，可否您给我程序我试一下？

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 04/20/2013 - 00:58

对统计分析没有影响。
下一次更新程序的时候，我把这个部分修改成自动置零吧。

[Data Vox Head]=rest_readfile('XXX.nii');
Data(31,:,:)=0;
rest_WriteNiftiImage(Data,Head,'NewXXX.nii');

Submitted by jigongjun on Mon, 04/22/2013 - 08:52

仅仅把中间一个体素的值置零可能不够吧。
因为做了平滑，中线区临近体素的高FC都有点假吧，是否需要根据平滑核的大小，设置中线区置零的范围？

Submitted by wleewell on Mon, 04/22/2013 - 14:05

这个建议很有道理，但是如果平滑在VMHC计算后进行的，应该就不涉及这个问题了。
统计学不受影响，其实也不是什么问题。