如何分析解释REST 的结果呢

Submitted by yanzhou on Mon, 10/26/2009 - 09:32

   按照DPARSF做了数据的分析后，对于结果我们怎么评价呢？是不是结果难以解释就是不可信的？请问如何了解数据的可靠性？是不是和前人的观点一样就是正确的呢？觉得有些茫然。。。

Submitted by ZangYF on Mon, 10/26/2009 - 11:23

所谓结果的可靠性，可以从组水平和个体水平看判断。

ReHo方法，对于一个个体的数据，很难说结果是否可靠。对于一组数据来说，我们通常可以做一个单样本t检验，以检验全脑中哪些脑区的ReHo值明显高于全脑均值。一般会发现，defualt mode network的脑区的ReHo值会明显高于全脑均值，并且在全脑中，这些脑区的ReHo值差不多是最高的。这种情况下，可就认为这组数据是可靠的。

如果是functional connectivity，可以选一个个体的数据，预处理后（包括空间平滑），选择PCC的一个ROI，functional connectivity结果通常会显示出较好的defaul mode network。这个标准，可以初步做为判断个体数据可靠性的方法。

组间或condition之间的结果，一般不可以用于检验数据的可靠性。至于与以往结果是否吻合，那要看情况。“难以解释，就不可信”，是不可信的。

Submitted by yanzhou on Mon, 10/26/2009 - 15:36

   谢谢臧老师的解答，我用的是ALFF方法，发现结果很散在，象噪声，我会再试试另两个分析方法的。

Submitted by yanzhou on Tue, 10/27/2009 - 09:06

根据REST的使用说明，选择数据，MASK选的是BrainMask_05_61x73x61，报错内容如下，请问该如何办？
Ideal rectangular filter: "D:\IA\Analysis\FunImgNormalized\Sub_001_detrend"
  Read 3D EPI functional images: "D:\IA\Analysis\FunImgNormalized\Sub_001_detrend"...........................................

  Load mask "E:\SPM5\toolbox\REST\mask\BrainMask_05_61x73x61.img".Warning: Values other than 0 or 1 converted to logical 1.
> In rest_loadmask at 52
  In rest_bandpass at 61
  In reho_gui>BandPass at 1220
  In reho_gui>btnComputeReho_Callback at 286
  In gui_mainfcn at 75
  In reho_gui at 34
  In rest_progress at 248
  In rest_waitbar at 76
  In rest_detrend at 36
  In reho_gui>Detrend at 1201
  In reho_gui>btnComputeReho_Callback at 278
  In gui_mainfcn at 75
  In reho_gui at 34

  Build band pass filtered mask. Wait...
  Band Pass Filter working. Wait...................
  ReConstructing 3D+time Dataset. Wait...................
  Saving filtered images. Wait.............................................
  Band pass filter over.
 Elapsed time is 525.571396 seconds.

ReHo :"D:\IA\Analysis\FunImgNormalized\Sub_005_detrend_filtered"
??? Undefined command/function 'rest_misc'.

Error in ==> reho_gui>btnComputeReho_Callback at 337
   rest_misc( 'DisplayLastException');

Error in ==> gui_mainfcn at 75
        feval(varargin{:});

Error in ==> reho_gui at 34
    gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});

??? Error using ==> drawnow
Error while evaluating uicontrol Callback.

??? Undefined command/function 'rest_misc'.

Error in ==> reho_gui>btnComputeReho_Callback at 337
   rest_misc( 'DisplayLastException');

Error in ==> gui_mainfcn at 75
        feval(varargin{:});

Error in ==> reho_gui at 34
    gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});

??? Error while evaluating uicontrol Callback.

??? Undefined command/function 'reho_gui'.

??? Error while evaluating uicontrol Callback.
 

Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 10/28/2009 - 13:41

??? Undefined command/function 'rest_misc'.

请检查一下REST的安装是否有问题。

Submitted by yanzhou on Thu, 10/29/2009 - 11:55

  又用功能连接的方法作了分析，想请教一下老师，得出的结果怎么再做ROI的分析，也就是每个个体特定的ROI的强度与临床的评分作相关，应该怎么做呢？

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 10/29/2009 - 14:47

把所有的被试功能连接图像放到一个文件夹，然后按COURSE中介绍的提取时间序列的方法把ROI中的值提取出来。
然后做相关即可。

Submitted by yanzhou on Fri, 10/30/2009 - 07:55

  我看了course,发现讲的比较简单，不太明白，老师能写个具体点的步骤吗？谢谢。

Submitted by YAN Chao-Gan on Sun, 11/01/2009 - 16:52

http://www.restfmri.net/forum/Course
仔细看一下Slice 64 到Slice 71，动手试试就好了。
另外，可能在这个月会出Course的第二部分，把提取时间序列部分再单独说说吧。请稍耐心等待一下。

Submitted by yanzhou on Thu, 11/05/2009 - 15:41

  我按照COURSE中介绍的方法提取功能连接计算的协变量，报错如下

>> RPCov=load('rp_aSub_001x011.txt');
>> BCWCov=load('ROI_FCMap_Sub_001_detrend_filtered.txt');
>> Cov=[RPCov,BCWCov];
??? Error using ==> horzcat
All matrices on a row in the bracketed expression must have the
 same number of rows.

请问是哪个步骤做错了呢？