Submitted by Authenty on Wed, 09/11/2013 - 08:58
各位老师和Resters,
教师节刚过,首先补送一句教师节快乐!
我在用VBM分析80位正常人的T1结构数据,由于已经有大量研究作为理论基础,我希望有选择性地提取出那些参与疼痛表征和调控的主要脑区(S1,S2,PFC,ACC,Insula和Thalamus)的灰质和白质volume,因此需要做一个只包含这些脑区的mask,但是在制作这个mask时,我遇到一些困难:
问题1. 首先,我尝试在BA模板中找到与以上6个脑区对应的mask,但是,发现BA模板中很难界定thalamus和insular,于是,我转向使用AAL模板。AAL模板的好处是对于thalamus和insula都有明确的分区(即,丘脑77Thalamus_L7101 丘脑78Thalamus_R7102;脑岛29Insula_L3001,脑岛30Insula_R3002),另外四个脑区比较靠近表层,也比较容易找到大致对应的AAL区域。我想请问各位老师,使用AAL模板制作以上6脑区mask的做法,可以被接受吗?
问题2. 使用以上方法,如果我分别根据BA模板找到S1,S2,PFC,ACC的mask1,再根据AAL模板找到insula和thalamus对应的mask2,再取这两个mask的并集,这样的方法比第一个方法好还是差呢?因为我对解剖了解的很少,对BA模板和AAL模板及其二者的关系了解的也不多,所以不清楚能否取mask1和mask2的并集。
问题3. 我有更好的方法找到并制作以上6个脑区的mask吗?
非常感谢老师们的解答!
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Wed, 09/11/2013 - 12:29 Permalink
Re: 如何制做包含“S1,S2,PFC,ACC,Insula和Thalamus”的mask?
用AAL模版的做法,是可以接受的。
你所说的并集,也是经常有人用的。
Submitted by Authenty on Wed, 09/11/2013 - 17:53 Permalink
Re: 如何制做包含“S1,S2,PFC,ACC,Insula和Thalamus”的mask?
多谢张老师的回答!
我想补充问清楚并集的问题,如果我不仅用AAL模板,还用BA模板,使用AAL选择Insula、Thalamus和ACC做mask1,用BA选择S1,S2和PFC做mask2,然后再取并集,这样也是可以的吧?
(note:mask2中,之所以用BA模板选择S1,S2和PFC,是因为不知这三个区域分别包括了哪些AAL分区,这点与mask1不同。)
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Thu, 09/12/2013 - 10:19 Permalink
Re: 如何制做包含“S1,S2,PFC,ACC,Insula和Thalamus”的mask?
我觉得说清楚就好,S1S2在AAL里好像没有分特别细,PFC包括了很多脑区,选择的时候要细致些。
总之,有文献支持,并且选择了正确的脑区,就没有问题。