Submitted by taolei329 on Fri, 09/13/2013 - 23:37
大家好,我的课题是老年性痴呆的功能磁共振研究,最近向导师汇报科研进度时,他问我能否把弥散张量的FA图与静息态图像进行融合,这样就可以对两者进行综合相关分析,我也查了一些文献,确实有一些研究者将两种图像进行了融合,于是我自己尝试了一下。
我用的磁共振是SIEMENS Trio 3.0T,文献上用的是GE或者飞利浦的磁共振,然后说将FA图进行空间标准化后,利用MRIcro软件将其与fMRI融合,我的理解是把FA序列得DICOM图像进行NORMALIZE后得到的文件叠加在MRIcro的fMRI图像上,然后我用DPARSF basic edition ,导入FA的图像,然后勾选DICOM to NIFTI,Slice timing,Realign,Normalize,然后RUN,结果MATLAB里面提示 说 index exceeds matrix dimension,下面一堆红色的ERROR。
我自己确实不知打如何进行FA和fMRI的融合,这只是一个尝试,希望有相关融合经验的同行、前辈高人指导一下具体的操作步骤。另外,matlab的提示是不是时候DTI扫描参数和fmri不一致?是不是由于不同厂家磁共振扫描的图像不同而导致的无法融合?又或是机型不是问题,而是方法的问题?谢谢!!
Submitted by ZangYF on Sat, 09/14/2013 - 18:01 Permalink
Re: 有关FA图与fmri图像的融合问题,求高人解答!!跪谢!!
将FA与静息态fMRI图像融合,简单来说可以在空间标准化之后进行叠加。但不同的研究其“融合”的目的是不同的。fMRI-BOLD主要针对的灰质,而FA针对的白质,简单的空间融合之后,恐怕只能靠我们的视觉判断其科学意义。比如,在某皮层脑区发现resting-state fMRI异常,在其附近的白质发现FA异常,或许提示二者有关联,但很难证实,除非进行纤维跟踪。再比如,在运动皮层发现resting-state fMRI的局部脑活动异常,而在皮层脊髓束的传导路上发现FA异常,意义很大,但这种情况下未必需要真正的图像融合技术。总之,一定要根据具体的研究目的决定是否融合。如果是纤维跟踪的结果与fMRI的结果的融合,相对来说重要得多。
Submitted by taolei329 on Sat, 09/14/2013 - 22:27 Permalink
Re: 有关FA图与fmri图像的融合问题,求高人解答!!跪谢!!
臧教授您好,非常感谢您的及时解答!
您提到纤维跟踪与fMRI结果融合,会更加重要,那纤维跟踪是不是指DTT,把白质纤维束的三维图像与fMRI结果相融合?这一融合过程又该如何进行,或者前面提到的将FA与fMRI进行融合?之前我也查过不少综合利用DTI、DTT与rs-fMRI研究其他一些,比如帕金森、癫痫等的研究,但是他们大多是把两中各自的研究结果放在一起做相关性分析,而稍有的融合之后再分析的,对如何进行融合基本都是一语带过,所以我还是想学习一下这个具体的操作方法。
我的导师对我的课题期望很高,我也希望能够尽量按照他的意思做下去。我现在研三,时间比较紧,所以还想充分利用现有的检查结果,再深入的多方面的做一点东西。所以希望臧教授能够指点一下该如何具体操作,或者有没有相关教程我能够学习的?
再次感谢!
Submitted by ZangYF on Sun, 09/15/2013 - 07:32 Permalink
Re: 有关FA图与fmri图像的融合问题,求高人解答!!跪谢!!
具体操作可以直接与廖伟或龚高浪联系。
Submitted by taolei329 on Sun, 09/15/2013 - 12:56 Permalink
Re: 有关FA图与fmri图像的融合问题,求高人解答!!跪谢!!
谢谢臧教授!
Submitted by taolei329 on Sun, 09/15/2013 - 13:29 Permalink
Re: 有关FA图与fmri图像的融合问题,求高人解答!!跪谢!!
臧教授,不好意思再问一下,请问您提到的 廖伟 和 龚高浪 两位老师的联系方式,如果可以的话,可以告诉我一下吗?邮箱就行,还有我应该如何称呼这两位老师呢?谢谢!!!