关于rest进行gca与spm进行dcm提取roi方法的比较问题

Submitted by taofly on Mon, 10/21/2013 - 10:26

严老师：
       您好！我用rest做gca，提取roi那步选的提取小球，它是通过平均小球内的体素得到的时间序列。看到不少文献说gca和PCA主成分结合的方法更好，于是尝试着将平均换成提取主成分的时间序列，效果不好，贡献率都太不集中了。请问您是否也考虑过主成分的方法呢？
       而另外一种效应连接，利用spm做dcm的时候，是在result里面的“eigenvariate”来提取roi，一不同是提取主成分，二不同是默认contrast的结果有显著性的点才能提取出来（问题是因为需要一个人一个人提取，一组人有显著性的点不一定在单个人上就有显著性），我对比了相同roi的rest和spm的提取结果，rest的有正有负，spm的竟然只有正值。不知道哪种方法更合理，以及会不会影响后面做效应连接的结果？
       感谢您对我的问题的关注和解答！
      

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Mon, 10/21/2013 - 17:05

 小球里面用平均和主成分都可以，没有preference。
你说的贡献率不集中得看数字，不过我觉得一个小球里的各个time course还是应该比较相似的，理应得出第一主成分占比80%以上的贡献率。

spm提取的值可能是没有经过中心化的数据（还有均值），而rest可能数据已经经过中心化了（减了均值），但影响应该没有。

Submitted by taofly on Wed, 10/23/2013 - 11:34

十分感谢老师您的耐心解答！还想麻烦问您下，在做dcm，用spm提取roi时，输入roi中心的坐标点，如果这个点不是contrast的显著性的点,就会自动跳到离它比较近的有显著性的点，作为roi的中心，但有时和我想要的中心点偏离较多，这种提取不是像rest那样可以指定中心点，请问做dcm提取roi时可以解决这个问题吗，谢谢老师！

Submitted by taofly on Wed, 10/23/2013 - 11:35

十分感谢老师您的耐心解答！还想麻烦问您下，在做dcm，用spm提取roi时，输入roi中心的坐标点，如果这个点不是contrast的显著性的点,就会自动跳到离它比较近的有显著性的点，作为roi的中心，但有时和我想要的中心点偏离较多，这种提取不是像rest那样可以指定中心点，请问做dcm提取roi时可以解决这个问题吗，谢谢老师！