xjview里根据peak点选取roi

Submitted by taofly on Tue, 10/29/2013 - 14:31

根据xjview里显示的cluster及peak点，选取最大峰值点作为小球roi的中心，下一步要做效应连接，但是一个T值很大的cluster的三个峰值点坐标都是白质的，比如xjview显示“ // Left Cerebrum // Frontal Lobe // Sub-Gyral // White Matter // undefined // Frontal_Inf_Tri_L (aal)"这是已经用了灰质mask了，而且cluster里白质还挺多，请问老师怎么选取roi中心好呢。可以选取这个落在白质区的最大peak点么，还是选择落在灰质区的Frontal_Inf_Tri_L，但不是最大的激活点作为roi中心呢？
1955 Left Cerebrum
 1795 Frontal Lobe
 1226 White Matter
  810 Inferior Frontal Gyrus
  609 Middle Frontal Gyrus
  601 Frontal_Inf_Tri_L (aal)
  565 Gray Matter
  364 Precentral_L (aal)
  288 Frontal_Inf_Orb_L (aal)
  260 Frontal_Mid_L (aal)......

Submitted by taofly on Mon, 11/04/2013 - 23:22

老师，这一点不太会操作，麻烦问您下“将MNI空间的T1在组上做个平均，作为你显示统计结果的underlying。”是通过spm的xjview么，怎么操作，谢谢您！

Submitted by jigongjun on Tue, 11/05/2013 - 01:16

 每个人的T1都转到MNI空间后，放在一个文件夹下，然后用rest-----“utilities”-----“Image calculator”求得该组人的平均T1像。
然后你用rest sliceviewer看结果的时候，选这个平均T1像作为underlying。

Submitted by Learner--ECNU on Tue, 11/05/2013 - 10:13

 老师我想追问一个，这个underlying是不同的模板对于Xjview或者Rest viewer显示结果有什么影响？还是用自己的T1像做的模板显示会更准确点

Submitted by admin on Sat, 11/02/2013 - 00:11

Check results with REST SliceViewer by Yoke:
1. load MNI template and load your statistical overlay
2. open a new SliceViewer by clicking "SliceViewer" button in the top of "Yoke" and "Crosshair"
3. Check Yoke for both SliceViewer
4. Open AAL template in new opened SliceViewer
5. Click a position in your statistical overlay and check where it is in the yoked AAL SliceViewer