Submitted by confirm on Wed, 08/21/2013 - 23:28
forum/sites/default/files/users/confirm/file/并集MASK问题(1).doc
老师,您好!在使用rest软件在制作并集MASK中遇到的一些问题,附在word文档里面了,希望老师指导和解答。谢谢!
forum/sites/default/files/users/confirm/file/并集MASK问题(1).doc
老师,您好!在使用rest软件在制作并集MASK中遇到的一些问题,附在word文档里面了,希望老师指导和解答。谢谢!
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Thu, 08/22/2013 - 08:54 Permalink
Re: 关于rest软件在制作并集MASK中遇到的一些问题
1 、在保存单t检验结果时,想要得到只有0和1的nii文件有点不太明白。我直接点save clusters得到的是1或2这样的图,得到的clusters没有变成兴趣区为1,其他区域为0这样的mask;而得到I或II这样仅0和1分布的图,需要再点一次save cluster(或者你之前点的save cluster就需要再点save clusters),这一次它会生成一个自命名的文件和一个BrainMask打头的文件也就是仅0和1分布的clusters。得到仅0和1分布的mask都需要这样么?(后来我尝试在ANOVA结果中保存clusters制作mask,只能得到类似1图那种非0分布的mask,无法得到仅0和1分布的多个兴趣区的mask结果,请问如和得到在ANOVA显著结果生产仅0和1分布的mask呢?)
ans: 点save clusters 再点 save cluster是不对的。如果你想做并集mask,只需要生成1和2的图,然后用 (i1>0+i2>0)>0即可。单样本t检验的0,1图不需要呈现。
2、对于保存得到的非0的MASK(1或2图),使用计算公式 (i1>0+i2>0)>0,这样计算的话是不是对应t<0的那些区域就不会出现在并集mask里面?我们只需要关心大于全脑均质的脑区,所以而不用关心t<0的区域划到mask里面么(因为文章中一般单t结果都显示大于全脑均值的脑区分布,而没有关心小于均值的脑区)?
ans: t<0的那些区域就不会出现在并集mask里面,对的。我们只关心大于全脑平均ALFF的脑区。
3、对于得到的1和0的MASK,照理说按照计算公式之后应该会是两个单t结果的并集的,但我对着前两者结果看是发现得到的并集MASK好像并非两者显著区域的一个叠加(如1图与2图的总和脑区并非与3图的一致,同样I和II图之和亦不和III图一致。随后我采用spm计算功能,采用最近插值法得到的和rest计算结果一致,但也不和合并前的两者区域叠加结果完全一致)?
ans: 这是因为你做错了,请看我问题1的回复。
张寒老师提到过ALFF可以不用制作并集MASK,不过这个制作过程让我产生了相关的疑惑,向老师请教一下,希望老师予以解答,谢谢。
ans: 是的,没有必要做mask。
Submitted by leeona on Fri, 12/20/2013 - 10:25 Permalink
Re: 关于rest软件在制作并集MASK中遇到的一些问题
关于问题3,我重复了一下这个问题,发现出现这种情况的原因是计算公式应该为 ((i1>0)+(i2>0))>0