Submitted by Learner--ECNU on Fri, 12/27/2013 - 17:38
老师好! 我现在手上有批病人数据,总的数据量还是挺多的,但是这些病人的病灶区不是都在同一侧,分成左右病灶组的话被试的数量就不多了,我现在研究的一个功能区并没有偏侧性,所以我想把这些病人的病灶人为地翻转,使它们在同一侧,之前好像看过一篇文献里提过这种技术但是没细讲实现过程,请问各位老师有什么软件可以做这个或者有什么经典文献?万分感谢啊!!
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Comments
Submitted by juefirst on Thu, 01/02/2014 - 15:27 Permalink
Re: 脑区翻转问题
你好:
我做过左右反转图像的工作,用的是同事写的小程序,如果数据不多的话,可以使用MRIcro手工反转,详情请见截图。
我做的是左右非对称性的研究,所以除反转之外还有一些必要的左右配准,对于你的研究我并不熟,后续还需要什么处理就不清楚了,所以只能帮到这么多,抱歉。
Submitted by Learner--ECNU on Thu, 01/02/2014 - 16:04 Permalink
Re: 脑区翻转问题
非常感谢你的帮助,MRIcro我用的不多,能否稍微具体指导下操作过程或者给个Manual,图的最下方三个Save是什么意思?万分感谢~
我还有个问题,我之前用SPM中的ImageCalc,输入表达式flipud(i1)可以实现图像的左右翻转,结构像这样翻转结果还好,但是功能像的话,我把4D数据(携带时间维度)翻转后,数据大小由原来的几十兆成了几百KB,直观看图是左右翻转了,但是感觉时间信息好像丢失了。我想问下你的功能像是怎么翻转的?我这儿的功能数据就是静息态的,不是任务态的。
Submitted by Dong-Qiang Liu on Tue, 01/07/2014 - 12:03 Permalink
Re: 脑区翻转问题
你好!对于常规一点的静息态数据分析的话,你可以在计算出个体结果后,对每个人的个体结果图使用spm中的ImageCalc的flipud(i1)表达式将其左右翻转。
Submitted by Learner--ECNU on Tue, 01/07/2014 - 20:48 Permalink
Re: 脑区翻转问题
你好,你的意思是功能态的数据在做统计之前把它翻转了再做统计?请问这个有什么文献支持吗?或者你已经实现过结果不错。谢谢指导~~
Submitted by Dong-Qiang Liu on Wed, 01/08/2014 - 16:48 Permalink
Re: 脑区翻转问题
事实上对4D数据翻转与对个体结果进行左右翻转是等效的。但无论对于哪种做法,翻转之后还需要进行左右配准,可以参考这篇文章:FMRI Study of Mesial Temporal Lobe Epilepsy Using Amplitude of Low-Frequency Fluctuation Analysis