resting soft

rest软件能在Matlab2008中用吗?

我想用rest软件做功能连接分析,用voxel wise求出种子点和全脑所有体素的相关性。首先对所有数据做预处理,包括slice timing, 头动校正,标准化,平滑和去线性漂移;标准化时参数设置为:bounding box:-90 -126 -72;  90 90 108    voxel sizes:3 3 3 ;这样得到的图像大小为61,73,61;做功能连接分析时需要添加协变量包括全脑信息、白质信息和脑脊液信息,提取这些信息的模板大小也是61 73 61。这些都可以很顺利的完成,但是在自己制作种子区域模板的时候我用的是WFU_PickAtlas,产生的是91,109,91大小的,这样就不能匹配上了,请问我上面的步骤有不对的地方吗?一般这种情况怎么处理?有什么软件可以做重切片吗?可以把91 109 91转换成61 73 61?

你需要把MASK文件的精度reslice成与你EPI数据一样的精度,然后先user define mask。
你可以使用晓伟的程序,也可以使用REST里面新添的一个GUI:Reslice Image。
视频里面有更多介绍。