Submitted by sunshine on Tue, 01/26/2010 - 12:43 rest软件能在Matlab2008中用吗? Log in or register to post comments 29136 reads Submitted by YAN Chao-Gan on Tue, 01/26/2010 - 16:51 Permalink Re 可以运行。 Log in or register to post comments Submitted by sunshine on Tue, 01/26/2010 - 18:57 Permalink 功能连接 我想用rest软件做功能连接分析,用voxel wise求出种子点和全脑所有体素的相关性。首先对所有数据做预处理,包括slice timing, 头动校正,标准化,平滑和去线性漂移;标准化时参数设置为:bounding box:-90 -126 -72; 90 90 108 voxel sizes:3 3 3 ;这样得到的图像大小为61,73,61;做功能连接分析时需要添加协变量包括全脑信息、白质信息和脑脊液信息,提取这些信息的模板大小也是61 73 61。这些都可以很顺利的完成,但是在自己制作种子区域模板的时候我用的是WFU_PickAtlas,产生的是91,109,91大小的,这样就不能匹配上了,请问我上面的步骤有不对的地方吗?一般这种情况怎么处理?有什么软件可以做重切片吗?可以把91 109 91转换成61 73 61? Log in or register to post comments Submitted by admin on Wed, 01/27/2010 - 09:17 Permalink ReSample Mask You may download rest_reSample3D.m from ReSample Mask in REST (http://www.restfmri.net/forum/node/78) Log in or register to post comments Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 01/27/2010 - 22:53 Permalink Re 你需要把MASK文件的精度reslice成与你EPI数据一样的精度,然后先user define mask。 你可以使用晓伟的程序,也可以使用REST里面新添的一个GUI:Reslice Image。 视频里面有更多介绍。 Log in or register to post comments Submitted by sunshine on Wed, 01/27/2010 - 23:28 Permalink 谢谢两位师兄,我再重新试一下。 谢谢两位师兄,我再重新试一下。 Log in or register to post comments
Submitted by YAN Chao-Gan on Tue, 01/26/2010 - 16:51 Permalink Re 可以运行。 Log in or register to post comments
Submitted by sunshine on Tue, 01/26/2010 - 18:57 Permalink 功能连接 我想用rest软件做功能连接分析,用voxel wise求出种子点和全脑所有体素的相关性。首先对所有数据做预处理,包括slice timing, 头动校正,标准化,平滑和去线性漂移;标准化时参数设置为:bounding box:-90 -126 -72; 90 90 108 voxel sizes:3 3 3 ;这样得到的图像大小为61,73,61;做功能连接分析时需要添加协变量包括全脑信息、白质信息和脑脊液信息,提取这些信息的模板大小也是61 73 61。这些都可以很顺利的完成,但是在自己制作种子区域模板的时候我用的是WFU_PickAtlas,产生的是91,109,91大小的,这样就不能匹配上了,请问我上面的步骤有不对的地方吗?一般这种情况怎么处理?有什么软件可以做重切片吗?可以把91 109 91转换成61 73 61? Log in or register to post comments
Submitted by admin on Wed, 01/27/2010 - 09:17 Permalink ReSample Mask You may download rest_reSample3D.m from ReSample Mask in REST (http://www.restfmri.net/forum/node/78) Log in or register to post comments
Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 01/27/2010 - 22:53 Permalink Re 你需要把MASK文件的精度reslice成与你EPI数据一样的精度,然后先user define mask。 你可以使用晓伟的程序,也可以使用REST里面新添的一个GUI:Reslice Image。 视频里面有更多介绍。 Log in or register to post comments
Submitted by sunshine on Wed, 01/27/2010 - 23:28 Permalink 谢谢两位师兄,我再重新试一下。 谢谢两位师兄,我再重新试一下。 Log in or register to post comments
Submitted by YAN Chao-Gan on Tue, 01/26/2010 - 16:51 Permalink
Re
可以运行。
Submitted by sunshine on Tue, 01/26/2010 - 18:57 Permalink
功能连接
我想用rest软件做功能连接分析,用voxel wise求出种子点和全脑所有体素的相关性。首先对所有数据做预处理,包括slice timing, 头动校正,标准化,平滑和去线性漂移;标准化时参数设置为:bounding box:-90 -126 -72; 90 90 108 voxel sizes:3 3 3 ;这样得到的图像大小为61,73,61;做功能连接分析时需要添加协变量包括全脑信息、白质信息和脑脊液信息,提取这些信息的模板大小也是61 73 61。这些都可以很顺利的完成,但是在自己制作种子区域模板的时候我用的是WFU_PickAtlas,产生的是91,109,91大小的,这样就不能匹配上了,请问我上面的步骤有不对的地方吗?一般这种情况怎么处理?有什么软件可以做重切片吗?可以把91 109 91转换成61 73 61?
Submitted by admin on Wed, 01/27/2010 - 09:17 Permalink
ReSample Mask
You may download rest_reSample3D.m fro m ReSample Mask in REST (http://www.restfmri.net/ forum/node/78)
Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 01/27/2010 - 22:53 Permalink
Re
你需要把MASK文件的精度reslice成与你EPI数据一样的精度,然后先user define mask。
你可以使用晓伟的程序,也可以使用REST里面新添的一个GUI:Reslice Image。
视频里面有更多介绍。
Submitted by sunshine on Wed, 01/27/2010 - 23:28 Permalink
谢谢两位师兄,我再重新试一下。
谢谢两位师兄,我再重新试一下。