Questions about AlphaSim correction

Submitted by nature84 on Tue, 03/04/2014 - 16:26

严老师您好，

      我在做AlphaSim校正，遇到一点疑问，如下。
      我想知道如果对于同一批样本，即使根据不同条件分组进行不同的统计分析（比如two-sample t-test, ANOVA, correlation), 是否做一次AphaSim校正就够了？还是针对不同的分析要分别做校正？我看到的这篇文章好像就属于后者http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3492266/#!po=38.3333，做了数次校正，不同的检验得到不同的P value和不同的mininal cluster size。但我的指导老师告诉我做同一个样本做一次就可以了。所以我现在比较疑惑，想像您请教一下哪一种正确。
      另外，我看了你们原始文章(REST: a toolkit for resting-state functional magnetic resonance imaging data processing. PloS one, 2011. 6(9): p. e25031.)里的相关部分，对这句话“A combination threshold of voxels' P<0.001 and cluster size >351 mm3 was considered significant, which corresponded with a corrected P<0.05.”里的which corresponded with P<0.05不太理解，能否请您稍微解释一下。希望能得到您的回复。非常感谢！

研究生
杨舒然

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 03/06/2014 - 23:51

舒然：

你好！

这篇文章做了几种不同的统计--组内统计、组间比较、相关分析。对于每种统计，都是需要进行多重比较校正的（直观地说，每个统计图都需要进行校正）。

理论上来说，做了多种不同的统计，也会存在多次比较的问题，但大多数文献通常都不对这样的多次比较进行校正。

这句话的意思，是通过控制单个体素的P值，以及之后形成的cluster大小（如果是散点，或cluster太小，可认为是随机误差），来达到校正后的P值。视频关于多重比较校正的部分有一些解释。

祝一切顺利！

超赣

Submitted by nature84 on Fri, 03/07/2014 - 09:58

严老师，

感谢您的回答！

所以说那些进行了多种不同统计的文献大都只做过一次校正，而且这样也是可以接受的（发表文章时不会被质疑）？

0.001是单个体素的P值，而0.05是校正后的P值，这样理解正确吗？不好意思能不能给我一个视频的链接，可能因为关键词没输对，我没有找到。

感谢！

杨舒然

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 03/08/2014 - 12:01

舒然：

你好！

是的，对每种统计做一次校正，然后不再做二次校正。通常还是可以被接受的。当然，你可以考虑采用bonferroni来做二次校正，即如果一共统计了N次，则每次要求校正后达到p<o.o5/N.

点Course的第二部分。

超赣