MICA

Submitted by Learner--ECNU on Sun, 03/23/2014 - 21:02

 请老师指点，运行MICA老是出现以下问题

*****Start to run analysis at 2014-03-23 20:55:28*****
------------------------------------------------------------------------------------
Generating the default mask using the first file of every subject
Creating Mask
Using first file of each subject to create default mask ...
 
Exception occured. ()
Error using nic_icatb_createMask (line 150)
Error in creating Mask
150#line, nic_icatb_createMask, in "E:\MICA\MICA_beta1.22_20120523\nic_functions\nic_icatb_createMask.m"
89#line, nic_rsdd_preprocess, in "E:\MICA\MICA_beta1.22_20120523\nic_rsdd_preprocess.m"
85#line, nic_rsdd_runAnalysis, in "E:\MICA\MICA_beta1.22_20120523\nic_rsdd_runAnalysis.m"
473#line, RulAll_Callback, in "E:\MICA\MICA_beta1.22_20120523\moica_gui.m"
96#line, gui_mainfcn, in "C:\Program Files\MATLAB\R2013a\toolbox\matlab\guide\gui_mainfcn.m"
57#line, moica_gui, in "E:\MICA\MICA_beta1.22_20120523\moica_gui.m"

Comments

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Wed, 03/26/2014 - 12:40

 你的预处理的数据要整理成为hdr/img的nifti格式，而且每个人都要查看已经配准的不错了，不要有配准失败的人。
另外，不需要做flitering 和 detrend， 不要用nii或4d nii格式。

Submitted by Learner--ECNU on Wed, 03/26/2014 - 22:05

 张老师你好，我尝试过把使用DPARSFA预处理完的4DNII数据使用REST转化为3D的img/hdr还是会报同样的错误，但是我后来把原始的数据再使用DPARSF预处理完，再用MICA跑的时候就不会出现这种问题了

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 03/28/2014 - 11:07

 你之前用DPARSFA处理的？现在使用DPARSF处理了就可以跑了？
 我还是觉得你DPARSFA的设置有问题，或者是DPARSFA处理完的数据有问题。方便的话给我传一个人的几个时间点我看看？

 总之 没有问题就好。我们也是用DPARSFA做的，一直是用DPARSFA，一直都没有问题。

Submitted by Learner--ECNU on Fri, 03/28/2014 - 13:03

张老师你之前回复的说用MICA处理数据的时候不要使用4D格式的，使用DPARSFA预处理完（做完平滑）之后每个被试就只有一个4D的数据，能用MICA跑下来？

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 03/28/2014 - 17:13

 所以说要用REST的nifti nii to nifti pairs 功能，将nii 4d数据convert成3D数据。