关于T1 coreg to Fun

各位老师,各位朋友: 我在处理rest fmri时,发现有好几个数据本来原始T1像是有小脑的,但coreg to Fun后,小脑就不全了,请问是怎么回事呢?该怎么处理呢?
co-T1正常情况:

co-T1小脑不全情况:

 这个有可能是co*.img就没有小脑了你看看。
 我单看这个coreg以后的结构像看不出来是不是和功能像对齐了,总感觉没有对齐特别是小脑附近。