关于DPARSF功能连接及连接矩阵的问题

Submitted by joyao1991 on Wed, 06/04/2014 - 22:22
各位老师好，遇到几个问题，想请教一下。
（1）用rest slice viewer将ROI自定义为AAL的前3个脑区。
用DPARSF做FC后，得到了一个ROI_FCMap_被试名.txt，里面有三列数据，是否是这3个ROI的时间序列？为什么和DPARSF中extract ROI time courses及extract AAL time courses的结果不同？
（2）restfmri网站上的教程说作统计分析的时候使用的是各被试的zFC*images。这个zFC*images指的是什么？用DPARSF做fc时生成了txt，mat及各脑区的nii文件。就是所有的z开头的nii文件吗？
（3）想分析小世界属性。提取时间序列，再通过corrcoef函数得到了各被试的连接矩阵。但是我有好几个被试，如果要分析这组被试整体或者说平均情况的话是否应该得到一个反应整体的连接矩阵？如何做？
期待各位老师的解答。

Submitted by xjtu2011 on Thu, 06/05/2014 - 00:23

 （1）这里面是一个“时间点×ROI数”的矩阵，也就是行（时间点）、列（ROI数目）；DPARSF中extract ROI time courses及extract AAL time courses可以直接计算出来相关系数邻接矩阵；
 （2）统计分析用的zFC图像，在你这里比如有3个ROI，就可以分别提取所有zROI1FCMap*.nii、zROI2FCMap*.nii、zROI13FCMap*.nii做Voxel-wise的功能连接组分析；如果要看这3个ROI之间的相关矩阵的统计差异，可能需要编程、使用NBS之类的；
  （3）不用那么麻烦，DPARSF中extract ROI time courses直接会计算出每一个人的相关系数邻接矩阵，相当于构建好了网络；接着使用其它软件继续计算拓扑属性指标。

Submitted by joyao1991 on Thu, 06/05/2014 - 10:00

 谢谢您的回答，有些地方还是不太明白：
（1）DPARSF做fc生成的ROI_FCMap_被试名.txt中的数字代表的是什么含义呢？或者说表示了什么？
（3）实验一共有6个被试，若要分析实验条件下的小世界属性，是否需要通过6个相关系数矩阵（每个被试得到一个相关系数矩阵）得到一个整体的相关系数矩阵（反映6个被试整体情况），然后在这个整体的相关系数矩阵基础上计算各属性？如何做？