关于SPM与DPARSFA 里的mask及个疑问

Submitted by yeshion on Mon, 06/30/2014 - 16:39

 各位老师好！
1、我在使用DPARSFA、REST等处理数据时，发现其中自带的Mask有这两种规格：91×109×91（voxel size=-2×2×2）,、61×73×61（voxel=-3×3×3）；而SPM8里面priori文件夹里只有91×109×91（voxel size=-2×2×2）。看到视频是讲解说DPARSFA、REST等用的Default Mask用的是SPM5先验模板threshold at 50%后的mask，请问这个mask就是61×73×61（voxel=-3×3×3）吗？
2、如果我用的是DPARSFA处理数据，normalize时用的是Voxel Size=3×3×3，那么我在后面选择模板的时候一定要选择相同体素的模板（Voxel Size=3×3×3），是吗？
3、在用SPM8做单样本t检验时，Explicit Mask选项不做任何选择的时候也可以出结果，请问Explicit Mask需要手动选择的吗？如果是自动默认，那就是SPM自带的91×109×91（voxel size=-2×2×2）咯？那我用DPARSFA做预处理选择的Mask是（Voxel Size=3×3×3），那这样做统计分析是不是错误的？

本人搞神经外科的，很多地方小白，还望老师详解，不胜感激！

Submitted by gaolei6096 on Mon, 06/30/2014 - 21:50

 1.一般做静息态功能图像指标计算时候，默认用的mask是Brainmask61×73×61维度的；
2.如果用默认的参数，后面的统计分析使用的mask也是用上述brainmask61×73×61的；
3.spm8里面统计分析时候可以不用选择，或者选择同样上述的mask，就是统计分析的个体/群组数据的维度和mask的维度要匹配，结果数据与mask的维度不同的话会出错。

Submitted by gaolei6096 on Sat, 04/09/2016 - 13:16

如果是91*109*91的，可以直接采用dparsf里面默认的91*109*91mask；或者用实际做统计分析的图像作为参照（比如标准化或者调制标准化之后的灰质图像，只是举例，实际上灰质图像不适合这样直接比较，还要另外thresholding），重新采样mask。