Submitted by leeona on Thu, 04/10/2014 - 11:30
张老师,您好!非常感谢您的 “How to report my result using REST slice viewer? v2.0” ,我在实际操作过程中遇到了一些问题,特向您请教。
1. 首先确认一个问题,我理解的alphasim校正是通过控制cluster的大小来实现的,这个理解对吗?
2. 实际操作时, 我双样本t检验后用的是slice viewer中的 alphasim 校正,得到的cluster中有两个特别大的(一个6千多,一个3千多,3*3*3,Individual voxel threshold probability = 0.05,校正后0.05),其他6个就是正常大小了。参照张老师的v2.0, 为解决大的cluster的问题,我在spm里重新做了一次双样本t检验。但spm8里只有fwe校正和none,并且两者后面均有extend threshold控制cluster的最小值。我开始选了fwe校正,但存活的点很少,且每个cluster均存活不超过10个voxel;我接着选了none,p值0.025(因为严老师视频里说spm做的单边统计,为了跟slice viewer一致,我把p值减了半),然后extend threshold填了aphasim校正时用的cluster的大小,然后得出的clusters的峰值位置大多还是跟slice viewer中一致的,但具体cluster中所包含的体素数有些差别,而张老师教程里头的cluster中包含的体素数是完全一致的。请问张老师,我这样处理有问题吗? 如果不对,请问rest里能做fwe校正吗?
Submitted by joyao1991 on Wed, 07/30/2014 - 10:38 Permalink
Re: 关于cluster report报告生成,学习了张老师的v2.0,遇到一些具体问题
师兄你好,请问“How to report my result using REST slice viewer? v2.0” 是在哪里下载的?我现在也遇到了组分析结果报告的问题
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 08/01/2014 - 10:03 Permalink
Re: 关于cluster report报告生成,学习了张老师的v2.0,遇到一些具体问题
http://restfmri.net/forum/node/1850
Submitted by joyao1991 on Tue, 08/26/2014 - 19:46 Permalink
Re: 关于cluster report报告生成,学习了张老师的v2.0,遇到一些具体问题
谢谢
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 08/01/2014 - 10:02 Permalink
Re: 关于cluster report报告生成,学习了张老师的v2.0,遇到一些具体问题
1. 对的。
2. 没有问题,spm除了报告一个cluster的最大值以外,还报告次高峰和第三高峰的voxel的坐标和值。 你可以看看是不是这样。你还可以选择spm的current cluster(而非whole brain)看看每个大的cluster里面有多少峰值(不只是rest里面报告一个峰值)。