求教有关GCA计算过程及其结果统计分析的问题

Submitted by xiaomi on Wed, 09/03/2014 - 16:22

 各位老师好！我对REST-GCA很感兴趣！最近刚开始初步学习！有一些问题不太明白！麻烦老师有时间帮我解答一下！
1、我不太理解GCA中的Coefficient- Based 与Residual-Based的区别，是不是一般默认的都是用 Coefficient- Based  方法？
2、我的ROI是使用Voxel Wise方式，计算结果中每个被试都有4种类型的x2x、x2y、y2x、y2y的nii文件，而且有没有经过z变换的一套(文件名是GCA……x2x.nii)，有经过Z-score transformation的一套（文件名是ZGCA……x2x.nii），我做统计的时候是选 Z-score transformation   的还是没有经过z变换的？
3、我自己尝试做了一下统计，我是用的 Z-score transformation 的nii数据，分别把每个人对应的同一类型（ x2x或x2y或y2x或y2y ）的文件挑出来组在一块，用spm做的单样本T检验！想问一下老师我这个方法对不对？为什么我的像x2x文件单样本T检验之后的结果时几乎全脑都有激活信号？

Submitted by Wei Liao on Thu, 09/04/2014 - 18:01

Hi,
1.关于残差和系数GCA的区别，可以在REST-GCA对应的文章中找到一些提示[ref: Zang, Z.X., et al., Granger causality analysis implementation on MATLAB: a graphic user interface toolkit for fMRI data processing. J Neurosci Methods, 2012, 203, 418-426.]。 没有规定要用残差或者系数，这取决于你的研究假设。
2. 一般多用经z变换后的。
3. x2x是某个ROI(seed)对’自己的‘GCA影响，其值都挺大，但是一般情况并不使用x2x 或者y2y。

Submitted by xiaomi on Thu, 09/04/2014 - 21:45

 十分感谢老师！
我还有一个小问题，麻烦老师有时间帮我解答一下！我有看其他文献有讲除x2y、y2x（x、y之间的线性直接影响）外还有一种x*y(x、y之间的瞬间间接影响)，不知道这个是通过哪个指标来分析？！
图例

Submitted by zangzx on Tue, 09/16/2014 - 16:11

对于voxel水平是这样。对于ROI水平的分析，你可以选择多个ROI用多元或者二元分析。如果用多元分析，就是把所有ROI都放在一个大的线性模型里，考虑到其他ROI影响。如果用二元分析，就是看两两之间关系，不考虑其他ROI影响。