fmri数据的detrend and filter

Submitted by You.Jia on Wed, 03/25/2015 - 15:53

老师，您好！
我想问一下，由于我的fmri数据太大，转换成hdr/img文件共2400个，所以没有办法一次做detrend和filter，总是out of memory，而且试了很多次大概一次240个对象（120个hdr和120个img）比较合适，那么如果我把它们分开放在几个文件中分别做detrend和filter可以吗？这么多的time points，我应该去除前多少个比较好呢,或者用多少个比较好呢？
我现在用的是spm8，数据是转成3D的nifti还是4D的好呢？

Comments

Submitted by jiaxize on Fri, 03/27/2015 - 07:13

 分开做和一起做结果应该是不一样的。out of memory是内存不够的提示，因为一次载入内存的内容比较多，
可以尝试的解决办法：
 1 加大内存
 2 根据论坛里面已有的帖子，试着打开3gb开关
 3 直接调用函数rest_bandpass(ADataDir, ...

    ASamplePeriod, ALowPass_HighCutoff, AHighPass_LowCutoff, ...
    AAddMeanBack, ...
    AMaskFilename,...
    CUTNUMBER)

其中CUTNUMBER设置的值大一点，CUTNUMBER的意思是，直接全部计算需要内存较大，所以分成若干个小部分计算。默认的CUTNUMBER为10，你可以改大一点。