post-hoc t-test

Submitted by annie1990923 on Thu, 07/30/2015 - 20:46

老师：
     您好！
     1.我有三组被试，先做了ANOVA, 得到了ANOVA显著的clusters, 然后save clusters做为mask，在这个mask里做two-sample post-hoc t-test.  用AlphaSim进行多重比较校正，那voxel level p值和 相应的cluster size是怎么定的呢（Alphasim矫正后的P为0.05 ）？
     2.我研究的是Reho, 审稿人提出要控制灰质、白质混杂因素，在两组之间比较时，我已经把灰质体积加入了协变量，白质是否也可作为协变量加入，是否有比较方便的工具量化白质呢？
     3.三组被试的人数需要完全一致吗？如果不一致的话，在数据分析的时候需要特别处理吗？

     谢谢！  
  annie

Submitted by ZangYF on Tue, 08/04/2015 - 18:13

1、可以这样做。Alphasim阈值的选择，请详细看一下Alphasim的使用。但需要注意的是，目前的软件并没有提供两两比较的多重比较校正（这儿，有三组共三次比较），这样会增加假阳性。比较严格的方法是采用Bonferroni（除以3）。
2、我认为即使灰质为协变量也应该慎重，没有证据显示灰质与ReHo是线性关系。比较严谨的做法，应该把加和不加协变量的结果都报告一下。
3、三组被试不一样，应该也是可以的。但好像有的ANOVA模型不支持（记得AFNI只支持三组相同）。如果不支持，只能使三组的样本一样。

Submitted by annie1990923 on Sat, 08/08/2015 - 19:39

 谢谢老师，1.如果不用anova,用multiple two-sample t-tests 进行两两比较的方法妥当吗？
               2.比较时把头动（FD）作为协变量,是否更好？

Submitted by ZangYF on Thu, 08/20/2015 - 05:19

1、直接采用两两比较，如果严格进行多重比较校正（不仅仅是校正多个体素，还要校正多次t-test），应该也是可以的。
2、加协变量总得来说是好的，但我个人一直推荐加和不加协变量的结果都报告，而不是只报告去协就是的结果。