Submitted by love fmri on Sun, 08/30/2015 - 12:44
各位老师好!
请教一个问题,DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based statistic connectome进行分析?具体问题如下:我用DPARSFA预处理31病人和31对照的rest state fMRI 数据,采用ROI-wise的方法对13个种子点进行FC分析,得到了FC文件夹下的每个subject的TXT文件,然后将这些TXT文件作为每个subject的matrix放入“network based statistic connectome (1.2 version)”软件进行分析,但是一直报错如下:
请教一个问题,DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based statistic connectome进行分析?具体问题如下:我用DPARSFA预处理31病人和31对照的rest state fMRI 数据,采用ROI-wise的方法对13个种子点进行FC分析,得到了FC文件夹下的每个subject的TXT文件,然后将这些TXT文件作为每个subject的matrix放入“network based statistic connectome (1.2 version)”软件进行分析,但是一直报错如下:
Error in ==> NBSrun>read_matrices at 369
ok=1;
??? Output argument "y" (and maybe others) not assigned during call to
"E:\tool\NBS\NBS1.2\NBSrun.m>read_matrices".
Error in ==> NBSrun at 185
[nbs.GLM.y,UI.matrices.ok,DIMS]=read_matrices(UI.matrices.ui);
Error in ==> NBS>get_ui at 174
NBSrun(UI,S);
??? Error while evaluating uicontrol Callback
请问这怎么解决呢?我看了NBS connectome(version 1.2)manual里写道matrix的格式应该如下:
Example connectivity matrix:
1.0000 0.5997 0.7259 0.6102 0.2896 0.7655
0.5997 1.0000 0.2918 0.5825 0.5418 0.4548
0.7259 0.2918 1.0000 0.7587 0.2357 0.7766
0.6102 0.5825 0.7587 1.0000 0.4586 0.6878
0.2896 0.5418 0.2357 0.4586 1.0000 0.2898
0.7655 0.4548 0.7766 0.6878 0.2898 1.0000
Example connectivity matrix:
1.0000 0.5997 0.7259 0.6102 0.2896 0.7655
0.5997 1.0000 0.2918 0.5825 0.5418 0.4548
0.7259 0.2918 1.0000 0.7587 0.2357 0.7766
0.6102 0.5825 0.7587 1.0000 0.4586 0.6878
0.2896 0.5418 0.2357 0.4586 1.0000 0.2898
0.7655 0.4548 0.7766 0.6878 0.2898 1.0000
但DPARSFA得到的FC文件下的TXT文件内格式每一列前面都比上面这个格式多一个空格,不知道是不是这个影响的结果?如果不是,那是什么问题?请问应该怎么解决呢?
非常期待各位老师的解疑!谢谢!
Submitted by gaolei6096 on Wed, 09/02/2015 - 10:05 Permalink
Re: 求助!DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based ...
可以,但是要确认一下是放置相关系数矩阵(FC)还是z转换后的矩阵(Z)。注意每个subject矩阵的名字改短一些。