Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 17:00 老师，您好！ 感谢您开发的这么好用的软件。现在我在做静息态数据的分析中有一个问题，想请教下。老师，就是计算ALFF和DC等指标时，会有一个重采样的mask，用dparsfa直接算的ALFF, 如果当时控制窗口现实的重采样mask是brainmask 91*109*91，那么做双样本分析时的mask选项，也一定要点击选择91*109*91吗？ 可以使用其他的mask嘛 ？ Log in or register to post comments 6869 reads Submitted by jiaxize on Wed, 09/02/2015 - 19:59 Permalink Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题， 您好，我不确定是否理解了你的问题。所以尝试回答一下。 在RSET软件做双样本分析的时候，MASK的作用相当于把你不感兴趣的地方“去掉”，换句话说，就是只在MASK内，voxel by voxel的做检验分析。这个MASK会影响到最后的校正结果，因为MASK越小，相应校正的时候，需要的团块也越小。 你说的问题是MASK的矩阵大小。这个矩阵大小，要和你的数据相匹配，比如说，你的数据时61*73*61的，那你使用的mask也要这么大。如果不一样大，从采样成这么大就可以了。 Log in or register to post comments Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 21:57 Permalink Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题， 嗯 我的意思是在dparsfa中直接一步到位算到每个个体的ALFF，但是滤波之后计算ALFF之前，有个重采样，如： “ Moving Dtrended Files:sub01 OK Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Computing ALFF... Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImgARCWSD\sub01". ” 这样的话，我在后面的做双样本T检验时和蒙特卡洛模拟时，需要rest里的mask时，一定要选择BrainMask_05_91x109x91.img嘛？ 可不可以选择61*73*61的mask哈 ？ 就是不选择91*109*91的mask允许嘛？ Log in or register to post comments Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 21:58 Permalink Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题， 嗯 我的意思是在dparsfa中直接一步到位算到每个个体的ALFF，但是滤波之后计算ALFF之前，有个重采样，如： “ Moving Dtrended Files:sub01 OK Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Computing ALFF... Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImgARCWSD\sub01". ” 这样的话，我在后面的做双样本T检验时和蒙特卡洛模拟时，需要rest里的mask时，一定要选择BrainMask_05_91x109x91.img嘛？ 可不可以选择61*73*61的mask哈 ？ 就是不选择91*109*91的mask允许嘛？ Log in or register to post comments
Submitted by jiaxize on Wed, 09/02/2015 - 19:59 Permalink Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题， 您好，我不确定是否理解了你的问题。所以尝试回答一下。 在RSET软件做双样本分析的时候，MASK的作用相当于把你不感兴趣的地方“去掉”，换句话说，就是只在MASK内，voxel by voxel的做检验分析。这个MASK会影响到最后的校正结果，因为MASK越小，相应校正的时候，需要的团块也越小。 你说的问题是MASK的矩阵大小。这个矩阵大小，要和你的数据相匹配，比如说，你的数据时61*73*61的，那你使用的mask也要这么大。如果不一样大，从采样成这么大就可以了。 Log in or register to post comments
Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 21:57 Permalink Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题， 嗯 我的意思是在dparsfa中直接一步到位算到每个个体的ALFF，但是滤波之后计算ALFF之前，有个重采样，如： “ Moving Dtrended Files:sub01 OK Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Computing ALFF... Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImgARCWSD\sub01". ” 这样的话，我在后面的做双样本T检验时和蒙特卡洛模拟时，需要rest里的mask时，一定要选择BrainMask_05_91x109x91.img嘛？ 可不可以选择61*73*61的mask哈 ？ 就是不选择91*109*91的mask允许嘛？ Log in or register to post comments
Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 21:58 Permalink Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题， 嗯 我的意思是在dparsfa中直接一步到位算到每个个体的ALFF，但是滤波之后计算ALFF之前，有个重采样，如： “ Moving Dtrended Files:sub01 OK Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images. Computing ALFF... Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImgARCWSD\sub01". ” 这样的话，我在后面的做双样本T检验时和蒙特卡洛模拟时，需要rest里的mask时，一定要选择BrainMask_05_91x109x91.img嘛？ 可不可以选择61*73*61的mask哈 ？ 就是不选择91*109*91的mask允许嘛？ Log in or register to post comments
Submitted by jiaxize on Wed, 09/02/2015 - 19:59 Permalink
Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题，
您好，我不确定是否理解了你的问题。所以尝试回答一下。
在RSET软件做双样本分析的时候，MASK的作用相当于把你不感兴趣的地方“去掉”，换句话说，就是只在MASK内，voxel by voxel的做检验分析。这个MASK会影响到最后的校正结果，因为MASK越小，相应校正的时候，需要的团块也越小。
你说的问题是MASK的矩阵大小。这个矩阵大小，要和你的数据相匹配，比如说，你的数据时61*73*61的，那你使用的mask也要这么大。如果不一样大，从采样成这么大就可以了。
Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 21:57 Permalink
Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题，
嗯 我的意思是在dparsfa中直接一步到位算到每个个体的ALFF，但是滤波之后计算ALFF之前，有个重采样，如： “ Moving Dtrended Files:sub01 OK
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Computing ALFF...
Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImgARCWSD\sub01". ”
这样的话，我在后面的做双样本T检验时和蒙特卡洛模拟时，需要rest里的mask时，一定要选择BrainMask_05_91x109x91.img嘛？ 可不可以选择61*73*61的mask哈 ？ 就是不选择91*109*91的mask允许嘛？
Submitted by zifei on Wed, 09/02/2015 - 21:58 Permalink
Re: 关于静息态分析中的重采样 mask的问题，
嗯 我的意思是在dparsfa中直接一步到位算到每个个体的ALFF，但是滤波之后计算ALFF之前，有个重采样，如： “ Moving Dtrended Files:sub01 OK
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (D:\soft\DPARSF_V2.3_130615\DPARSF_V2.3_130615\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Computing ALFF...
Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImgARCWSD\sub01". ”
这样的话，我在后面的做双样本T检验时和蒙特卡洛模拟时，需要rest里的mask时，一定要选择BrainMask_05_91x109x91.img嘛？ 可不可以选择61*73*61的mask哈 ？ 就是不选择91*109*91的mask允许嘛？