如果我在一个cluster发现了几个脑区的ALFF值变化,其中有一个cluster包括了额下回和岛叶,但是我的临床症状和alff做相关的时候,只有一个岛叶的cluster,并不包括额下回。这样的话,我可以把cluster分开报告么?
ALFF_Patient-NC Brain region AAL Cluster NO. X Y Z Peak CL L-Insula 29 02 -39 39 3 6.225 11 L-Inferior Frontal Gyrus 13,15 02 -39 39 3 6.225 117 ALFF与临床症状相关 Brain region AAL Cluster NO. X Y Z Peak CL L-Insula 29 15 -39 -9 15 0.89 12
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Submitted by ZangYF on Tue, 11/10/2015 - 09:04 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
我认为不应该分开报告cluster,可以在报告peak位置的时候,提一下extending to XXX,在但在相关分析的结果中,讲清楚最相关的区域在哪个cluster,但并不在peak位置。
Submitted by lionkiss on Tue, 11/10/2015 - 19:30 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
我现在遇到的问题是在我的治疗前组减去对照组的ALFF和ReHo的cluster都太多了,往往在一个AAL脑区里面有好几个cluster,这样怎么报告比较合适呢?
Submitted by ZangYF on Wed, 11/11/2015 - 09:49 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
如果一个脑区有多个clusters,分别报告即可;如果一个clusters有多个脑区,一般只报告peak voxel那个脑区,在特别必要的情况下,可以加extending to XXX (其它重要脑区)。
如果cluster很多,但不是很大,我认为不必管它;但如果cluster太大(在两个独立样本t-test的情况下,除非样本量很大,一般不会太显著),可以考虑提高阈值。
Submitted by lionkiss on Thu, 11/12/2015 - 22:33 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
谢谢臧老师
0.01的时候, ALFF这个cluster是900多,ReHo是1300
ALFF用到了0.001 还是445......
我能不能说显示了一个limbic system相关的超大的cluster?
这是临床指标和图像指标做了相关的cluster。
我其他指标相关都选了0.01,比较合适我的假设。
Cluster 3
Number of voxels: 445
Peak MNI coordinate: 12 24 -15
Peak MNI coordinate region: // Right Cerebrum // Frontal Lobe // Medial Frontal Gyrus // Gray Matter // brodmann area 25 // Rectus_R (aal)
Peak intensity: 0.94108
# voxels structure
445 --TOTAL # VOXELS--
243 Frontal Lobe
203 White Matter
187 Left Cerebrum
184 Right Cerebrum
152 Gray Matter
80 Limbic Lobe
77 Subcallosal Gyrus
75 Anterior Cingulate
65 Medial Frontal Gyrus
46 Sub-lobar
45 Frontal_Med_Orb_R (aal)
42 Rectus_R (aal)
41 Olfactory_L (aal)
36 brodmann area 25
32 Inferior Frontal Gyrus
30 Sub-Gyral
29 brodmann area 47
29 Caudate_L (aal)
28 Middle Frontal Gyrus
25 Frontal_Inf_Orb_L (aal)
23 Rectus_L (aal)
21 Inter-Hemispheric
21 brodmann area 32
20 Cingulum_Ant_L (aal)
20 brodmann area 11
20 Olfactory_R (aal)
18 Frontal_Sup_Orb_R (aal)
16 Caudate_R (aal)
15 Caudate Head
15 Frontal_Mid_Orb_L (aal)
15 Caudate
14 Frontal_Med_Orb_L (aal)
11 Extra-Nuclear
11 Frontal_Sup_Orb_L (aal)
10 Lentiform Nucleus
9 Cingulum_Ant_R (aal)
9 Putamen
7 Putamen_L (aal)
7 Putamen_R (aal)
7 Temporal_Pole_Sup_L (aal)
5 Rectal Gyrus
5 Uncus
4 brodmann area 10
4 Orbital Gyrus
3 Frontal_Inf_Orb_R (aal)
3 brodmann area 24
2 Frontal_Sup_Medial_R (aal)
2 Temporal Lobe
2 brodmann area 34
2 Pallidum_L (aal)
2 ParaHippocampal_L (aal)
1 brodmann area 38
1 Lateral Globus Pallidus
1 brodmann area 28
Submitted by lionkiss on Thu, 11/12/2015 - 23:24 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
呵呵,有点用ALFF和Reho做出了ICA的感觉......
Submitted by ZangYF on Sat, 11/14/2015 - 01:53 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
Peak 点的值达到0.94108,这是r值吗?样本量有多大?具体是什么量表?这么高的r值,尽管是peak,也太大了。即使样本量大,r值这么高也不多见。请仔细检查一下。
Submitted by lionkiss on Sat, 11/14/2015 - 15:00 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
我没有用量表,这是临床血液检测的水平和图像做的相关。
属于罕见疾病,样本量非常小,只有15.最高的r值是0.96
另外一组血液检测也做出了0.8-0.9左右的r值,和Precuneus和双侧顶下小叶,还有左侧脑岛相关。
其他二十几个指标和几个简单的精神量表和图像的相关,我正在做,似乎都无关。
这些我已经都加上了年龄,性别,教育做协变量。
样本量小,这样是不是可信度很低?
我现在只有15个治疗前组,15个治疗后组,我从30个对照组里面挑了17个年龄,性别,教育匹配的做对照。
r太高也会有问题么?我的三个假设可能会相关的激素都和ALFF,还有REho在特定脑区密切相关,和我的假设符合的很好。
Submitted by ZangYF on Mon, 11/16/2015 - 06:10 Permalink
Re: 可以分开报告cluster么?
如果是量表,这么高的相关系数,的确不可信。但既然是非常客观的指标,这么高的相关,还真有可能是比较重要的发现!