请问用rest怎样提取纹状体灰质体积，能通过predefine ROI from ALL template by selecting specific area 进行吗？

Submitted by haishijiandanhao on Thu, 03/17/2016 - 01:46

请问用rest怎样提取纹状体灰质体积，能通过predefine ROI from ALL template by selecting specific area 进行吗？还有用SPM算VBM得出的nii图像怎么用rest打开？总是提示要reslice,但是当用reslice功能时根本无法打开SPM得出的nii图像？请问这该怎么解决呢？

我的目的是把一组被试的纹状体体积提取出来，然后与其某个脑区的ALFF值做相关。谢谢老师！

Submitted by ZangYF on Thu, 03/17/2016 - 06:29

我只回答纹状体体积的问题。读数据的问题，请高手回答。

纹状体的体积，假定以壳核为例，金标准是手工勾画出来，计算其体积。另一个方法好像是通过配准+分割，并利用一个概率图（好像是FreeSurfer的方法，我不是很确定）自动计算。上面这两个方法计算的都是真正的体积。SPM中还有一种volume，也只能译为体积，是voxel-based，称为gray matter volume，与gray matter density有类似之处。gray matter density反映了某个voxel属于属于灰质的可能性，相对比较容易理解，但我对于SPM的这个Gray matter volume的真正概念一直不是非常理解。

Submitted by haishijiandanhao on Thu, 03/17/2016 - 11:29

谢谢臧老师的回答。

之前没有表述清楚，我想要提取的其实就是striatum的 volume。因为我用VBM算法比较了病人组与对照组在这个脑区有差异，但是用ALFF算法却没有发现它的ALFF 值有差异，现在想看一下striatum的volume和ALFF值是否存在相关性。ALFF值我已经用REST提取出来了，但是Volume却不知道怎么提取？麻烦老师指导了。