Submitted by wujingxi on Mon, 05/02/2016 - 01:31
大神:
数据处理过程中有时候会涉及到*.img/*.hdr和*.nii格式互换的问题,有没有现成的工具能将两种格式进行转换?
比如:我们利用老版本的DPARSF进行了dicom到analyze格式数据的转换,做了reslice timing,现在想利用DPABI做从Realign以后的部分,但是DPABI要求输入的数据是NIFTI格式,也即是说我需要把*.img/*.hdr转成Nifti格式,如何操作?
P.S.:我用的比较熟悉的是基于MATLAB的软件包
Submitted by jiaxize on Mon, 05/02/2016 - 11:42 Permalink
Re: 如何利用工具将*.img/*.hdr和*.nii格式互换
我记得旧版的DPARSF 好像是2.3 可以用img/hdr做为输入,然后生成的是4d nii数据。如果你想用dpabi,你可以先用旧版的DPARSF做一步,然后其余的用dpabi做。或者编程也可以,用rest_to4d读入,然后用rest_write4DNIfTI写成nii就可以了。
Submitted by 康康 on Tue, 05/03/2016 - 14:03 Permalink
Re: 如何利用工具将*.img/*.hdr和*.nii格式互换
我想咨询一下,img/hdr做为输入,然后生成的是4d nii数据后会对数据产生什么影响呢?我把经过平滑的数据img/hdr转为4d nii,然后做ICA,利用MDL自动估计产生成分数目一千多个,这很不正常。
Submitted by jiaxize on Thu, 05/05/2016 - 09:10 Permalink
Re: 如何利用工具将*.img/*.hdr和*.nii格式互换
4d nii 和img/hdr 只是格式的区别,里面的数据实际上是一样的。但是不同的软件支持的默认格式是不一样的。如果你转换过程没问题,建议你查看下MDL的文件输入是什么格式的。