Submitted by luohaha on Wed, 07/20/2016 - 20:58
老师:
您好。我想请教一下您关于SPM8做双因素析因设计方差分析,希望您能在百忙中抽空回复。我想分析一下疾病诊断ZD(正常人,焦虑患者)的脑皮层灰质密度与基因型JY(危险基因位点,正常基因位点)的关系。我之前在网上找了很多资料,都没有办法解决疑问。
我分析的过程是:首先要分析的图像是经分割并平滑后图像,SPM8中选specify 2nd-level,参数如下:
分析完后得到SPM.mat,选择SPM.mat经Estimate后,产生的数据如下
然后直接选择SPM.mat进行Results,步骤如下:
我的问题是:1、我分析的过程有无错误(因为我是按照网上来做,不知道对错)?2、开始用于SPM8分析图像是经预处理分割并平滑后图像吗?3、Estimate后产生的数据中,spmF和spmT分别代表什么?4、Results后,对ZD的主效应进行分析,好像我没得到分析的结果,运行文件夹没有出现统计分析的文件,如spmT,这样是对的么?结果该怎么看?期盼老师您的回复,祝工作顺利!!
Submitted by gaolei6096 on Sun, 07/24/2016 - 07:36 Permalink
Re: 请教关于SPM8做双因素析因设计方差分析
1.group×基因分型的2×2方差分析,这里就是需要考虑一下模型建立是否正确,比如因素间是否独立,可以贴上一些参考文献。
2.已提到是灰质密度,就是分割c1、并空间标准化和平滑之后的图像。
3.F和T分别是只有范围(没有方向性)和既有范围又有方向性(正负)的统计参数图。
4.全因素分析就是这样的输出结果,图像代表的含义和contrast manager界面的提示是一致的,详细的分析在先前的帖子中应该也有,可以搜索一下。
Submitted by luohaha on Mon, 07/25/2016 - 20:11 Permalink
Re: 请教关于SPM8做双因素析因设计方差分析
老师,您好。关于您的第3点回复,我想请教一下:1、Estimate中产生的spmF_0001-0004、spmT_0005-0008(图1)与Results中Select contrasts(图2)中的设置条件001-008是一一对应的吗?2、我查了一下以往的帖子,假设我要对ZD的主效应进行分析,那么我应该是选Select contrasts中006{T}:Positive effect of ZD_1,而不是002{F},对吗?3、另外005{T}:Positive effect of condition_1代表什么意思?期盼老师您的回复
图1
图2
Submitted by gaolei6096 on Tue, 07/26/2016 - 13:52 Permalink
Re: 请教关于SPM8做双因素析因设计方差分析
1.是的;2.这两个其实是一样的,但是T图带有方向性能同时显示正负,F图只有范围没有方向。3.这个我也不太清楚,好像678就可以了。
Submitted by luohaha on Sun, 11/06/2016 - 01:04 Permalink
Re: 请教关于SPM8做双因素析因设计方差分析
老师:您好。之前做请教您SPM8做双因素析因设计方差分析,做出了一些结果。可在最近我看VBM8-Manual后对自己之前的软件操作出现了疑问。我对这些分析步骤没什么疑问。
而在对结果进行显示时,我疑问是1、下面红色箭头所指的是显示性别、利手的主效应结果吗?箭头上面的4点是不是各水平的单独效应?2、在SPM8软件中,假设我的Positive effect of ZD_1代表性别,Positive effect of JY_1代表利手,要显示它们两个的主效应结果不是直接选中软件中的Positive effect of ZD_1,Positive effect of JY_1进行分析就可以了吗?怎么还要进行自己设置?(我尝试自己设置的和直接从软件选中,两种结果不一样),期盼老师您的回复,谢谢!