Submitted by yanyisecret on Fri, 07/22/2016 - 11:42
各位老师,大家好,我现在在使用dpabi进行alphasim校正的时候遇到一个问题,希望老师能予以解答。
基本信息如下:我将VBM处理之后的SPMT图导入之后,选择重采样之后的mask文件,估计了平滑核等参数,然后iteration选择默认的1000,p选择了0.05,出现如下报错信息,如果p为0.01的话则可以顺利进行。
还有一个问题就是,在这种情况下,可以不可以使用p为0.01的这个文件看p为0.05的时候的voxels填入xjview等软件进行结果的查看?
Submitted by gaolei6096 on Sun, 07/24/2016 - 07:15 Permalink
Re: 关于dpabi进行alphasim报错
这两种体素水平的p值,特别是0.05基本上不可接受;可否上传一个spmT图像呢,我来帮你试试?
Submitted by yanyisecret on Sun, 07/24/2016 - 17:32 Permalink
Re: 关于dpabi进行alphasim报错
前辈,您好!非常感谢您的帮助,我看了一下附件最大是5M,那个SpmT图是8M多,应该如何上传呢?另外我有三个问题,1.我按照报错信息,把y_AlphaSim中第40行中的“VariableLine=10000; %YAN Chao-Gan 091215. %VariableLine=3000;”10000改为了3000,这样就不报错了,但是会不会影响结果?2.关于体素水平的阈值,我的理解是未校正的话用0.001或者0.005,但是如果进行alphasim校正的话会卡一个cluster size,所以p值卡的比较宽,不知道前辈一般用的是什么样的阈值呢?3.我用同样的参数跑了几次,发现结果存在些许差异,虽然cluster size相差不超过100,但是有差到几十这种,这是什么缘故呢?(第一次在这个论坛上发帖子,好多功能不太熟悉,还望见谅!)
Submitted by gaolei6096 on Tue, 07/26/2016 - 14:04 Permalink
Re: 关于dpabi进行alphasim报错
1.这个问题不太清楚,您可以问问严老师,另外也可以尝试比较新一些的软件版本;2.体素水平未校正+cluster size thresholded,这个cluster size是结合有效平滑核自动估算出来的,这里最近争议比较多,我也不太清楚,但是似乎说体素水平p小一些更好,比如这里的0.001,而且p越小,需要达到阈值的cluster size越小,这样空间特异性也好一些。所以这里体素0.001未校正,加团块大小限制的话,最后阈值算到几十个体素是比较正常的。
Submitted by yanyisecret on Tue, 07/26/2016 - 15:23 Permalink
Re: 关于dpabi进行alphasim报错
好的,非常感谢您的解答,祝您生活愉快!