用rest做统计分析

Submitted by 小皮蛋 on Fri, 07/22/2016 - 11:33

你好！看到有人用rest做统计分析时，先做两组被试的单样本T检验，得到的显著区域做并集mask，在这个mask下进行双样本T检验。如果是在全脑做的双样本T检验，rest只产生一个T图，那么在做alphasim较正的时候，估计平滑核用什么mask呢，下面的mask要用AAL模板吗？可是有人说估计平滑核的mask和下面的mask要用相同的，用spm可以产生mask，但是rest没有生成相关文件该怎么办呢？谢谢！

Submitted by gaolei6096 on Sun, 07/24/2016 - 07:26

不知道我的理解是否正确，这里的“下面的mask”是指什么呢？是指高清解剖的underly template，或者说是用于统计分析、限定分析范围的二值化mask呢？

使用两组（或多组）单样本t检验的结果作为随后两样本分析的mask需要参照已有的文献、仔细考虑，如果使用这两者的卡阈值后结果并集做mask，这个mask应该可以同时用做估算有效平滑核和校正的。

关于生成mask，可以使用rest sliceviewer和image calculate中的功能来实现。

Submitted by 小皮蛋 on Mon, 07/25/2016 - 10:06

你好，如果我现在不用单样本t检验的结果做并集mask。只是在全脑进行双样本t检验，用rest生成的是一个T图，我在做alphasim较正时，估计平滑核就是用这个T图估计吧？那mask文件就是选择AAL模板吗？
另外，关于alphasim较正的原理，我在网上搜不到有用的信息，请问您是否有这方面的资料？

Submitted by 小皮蛋 on Mon, 07/25/2016 - 10:15

还有一个问题就是，我用rest做出来的统计T图，在slice viewer中可以正常显示，设置P值等。但是用xjview打开，显示的df是1,然后设置P值就会显示没有激活区域。但是在slice viewer中是有明显的激活区域的。这种现象可以解决吗？

Submitted by gaolei6096 on Tue, 07/26/2016 - 13:49

这个可能确实是一个问题，一个解决办法是使用SPM做统计分析，最后得到的spmT文件在上述看图软件中能很好展示自由度，和相应的调节p值。

Submitted by gaolei6096 on Fri, 07/29/2016 - 11:02

对，可以的。SPM的2水平分析和REST中做出来的是一样的，只是spmT包含的自由度信息可以在Xjview之类的看图软件中显示出来。