Submitted by lionkiss on Tue, 08/09/2016 - 21:21
老师好，我投出去的ALFF的文章被拒了，一个reviewer说不太愿意接受alphasim的校正，如果要有，至少要clusters在100-200才可以接受。
我用FDR做了，没有结果。
但是用rest推荐的GRF的结果做出来的却非常不错，比alphasim的cluster大好多，每个cluster都在100以上了。
但是我有点疑问，是不是GRF的校正使用不太普遍？ 我看到网上的文章大多使用alphasim或者FDR和FWE，GRF似乎只有不多的几篇。
GRF是可以被普遍接受的校正方法么？
Submitted by gaolei6096 on Thu, 08/11/2016 - 20:20 Permalink
Re: GRF校正的疑惑
“Cluster size在100-200体素数才可以接受”不知道是在什么样的体素水平阈值（即，体素水平p=0.01，或者0.001？）背景下。alphasim和GRF都属于cluster-level校正，在严格控制体素水平p值，和估算有效平滑核的情况下，两者的结果可能比较接近，校正后存活团块大小受体素水平p值选择的影响。
GRF校正的文章还是比较多的，根据现在的情况，可能需要控制严格一些的体素p值，和估算有效平滑核。体素p阈值选择越严格，可以存活的cluster校正团块阈值越小，空间特异度越好，同时也能降低假阳性。
Submitted by lionkiss on Fri, 08/12/2016 - 12:47 Permalink
Re: GRF校正的疑惑
我选择的体素水平是0.01，cluster是22个，review不认可。既然FDR我是没有做出结果，可以选用GRF矫正么？
我用alphasim做出了5个cluster，大小在30左右，如果选用GRF矫正，在voxel Z>2.3， cluster level p<0.1情况下，这5个cluster都是在200左右。
如果voxel Z>2.3， cluster level p<0.1，那么对应的P值应该是0.05么？
如果我想做到P<0.01，应该选择voxel Z>2.3， cluster level p<0.05？
这样的话，是不是容易被接受一点？
Submitted by lionkiss on Fri, 08/12/2016 - 12:47 Permalink
Re: GRF校正的疑惑
我选择的体素水平是0.01，cluster是22个，review不认可。既然FDR我是没有做出结果，可以选用GRF矫正么？
我用alphasim做出了5个cluster，大小在30左右，如果选用GRF矫正，在voxel Z>2.3， cluster level p<0.1情况下，这5个cluster都是在200左右。
如果voxel Z>2.3， cluster level p<0.1，那么对应的P值应该是0.05么？
如果我想做到P<0.01，应该选择voxel Z>2.3， cluster level p<0.05？
这样的话，是不是容易被接受一点？