关于alphasim的使用

Submitted by carolm2 on Sun, 07/03/2016 - 13:28

各位前辈好！

      我现在做了一个两样本t检验，打算在rest里面使用alphasim来估计cluster size，首先需要估计平滑核，具体界面见附件。里面需要输入三个文件才能估计平滑核，其中中间的mask file是做两样本t检验的mask吗？那其余的input statistical map和 FWHM of statistical map需要输入什么呢？

      谢谢各位！

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Submitted by gaolei6096 on Tue, 07/05/2016 - 09:14

建议挂载新一点的版本REST，参数设置见截图（默认参数，windows下的）。

其余的分别加入统计参数图（input statistical map）和目标mask（自定的，与统计参数图同样维度的），FWHM of statistical map使用上面的estimate来估算。

Submitted by echoqiu77 on Wed, 08/24/2016 - 02:42

正好我也对这个AlphaSim的计算方法没有掌握到，看了你的回复还是不确定。

问题1：为什么这个FWHMY要在估算呢？不是我们在对这批数据进行预处理时选的平滑核的大小吗？

问题2：在点进Estimate后，input statistical map： 是选比如T检验的结果是吧？；Input Mask File,是选比如我做前面统计图用的REST自带的全脑的Mask，这里也选那个全脑的Mask吗？最后那个FWHM of statistical map选项是可以不用选留空吗？

怎么感觉估出来的不太对，我估出来是15.94了，最后算出来时需要400多个体素，这是怎么回事呢？