双样本T检验的Alphasim校正

Submitted by fruitfly on Mon, 04/10/2017 - 19:57

请教各位老师两个问题：

1.对双样本T检验进行Alphasim校正，是选用T检验的结果做为mask？还是选用什么文件作为mask？

2.在确定了cluster之后，在rest的Slice viewer中，输入的P值是输0.01还是输0.05?

谢谢各位老师赐教。

Submitted by gaolei6096 on Thu, 04/13/2017 - 08:30

1.一般是选用全脑mask，比如rest里默认的brain mask 61 73 61，选用t检验的结果作为mask需要考虑为什么这么做（例如ICA成分内分析等）；

2.这里有歧义。如果校正之后有存活的cluster，这个cluster可以保存下来，随后看结果就不用设置p值、而是最多设置一个voxel size的最小值。如果是已知校正所使用的voxel p+cluster size的阈值，分别输入这些信息就可以，不过0.01和0.05作为体素p都是不太适合作为正式结果的阈值的，具体可以查阅相关多重校正的帖子、及关于cluster failure PNAS等的讨论。