在学习静息态过程中碰到的几个小问题

Submitted by demonpupil on Wed, 08/11/2010 - 22:38

老师们好：
  在学习了course之后我有几个小问题想请教一下各位老师
  1.关于单样本T检验：用一组病人的mReHo做单样本T检验结果（下图一）与用smReHo做出的结果（下图二）有不同，这样的话可能会导致两个样本T检验时设置两组病人都有显著变化的的并集mask时出现差异，从而影响最后结果，我想请教一下的是我们做单样本T检验时是用mReHo好呢还是用smReHo好？
                                                     

                                                                  图一

                                                                        图二
2.关于报表时的BA分区书写：在报表时一个cluster我用肉眼观察发现它横跨了两个BA分区，但是用cluster report找到该cluster的peak点MNI坐标所对应的BA分区只有一个，那么我报该cluster的BA分区是否应该根据peak点对应的那一个来报？

3.关于用Rest slice viewer做alphasim校正，校正前P<0.01校正之后图像上显著改变的区域倒是发生了变化，但是slice viewer显示的p值为什么还是p<0.01呢？进行多重比较校正后p值不是应该发生变化吗？

4.关于用Rest做双样本T检验时，我想要去除灰质协变量，这时我该利用DPARSF的nomalize功能分割出的wc1开头的灰质含量做协变量呢还是用mwc1开头的灰质体积做协变量呢？

5.在Rest自带的brain mask中它们命名为05 61*73*61，其中05的意思是百分之五十的阈值，而脑脊液是 07 61*73*61。这个阈值指的是什么，为什么有的选百分之五十有的选百分之七十呢？

6.若将年龄作为协变量去除，可否根据被试顺序，按男性=1，女性=0，作出一个TXT.文件作为协变量加入？

有些概念我还十分模糊，非常期盼老师们能对这几个小问题做出回答，非常感谢！！

Submitted by ZangYF on Sat, 08/14/2010 - 09:12

首先谢谢你的问题。
 
1.　voxel-by-voxel统计之前，进行空间平滑，基本上是常规做法。所以，应该采用smReHo图。单样本t检验时，一般我们不会关心哪些部位的值低于全脑均值，所以，只显示单侧，即正的t值即可。另外，我注意到，即使采用smReHo， p值在0.01时，你的阈值显示的9.9，是不是没有减去均值，然后与0进行单样本t检验？应该是有问题的。
 
2.这些现象很常见。我个人推荐的做法是：报告peak点所在脑区的同时，注明extending to另一个脑区
 
3.采用AlphaSim校正后，显示的时候，p值是不发生变化的。报告时，需要同时报告voxel的最大p值（p<?）、cluster的最小体积（>? mm3），以及校正后对应的p值。
 
4.这个问题我不专业，请超赣帮忙回答。目前他不在北京。请稍等。
 
5. 07 61*73*61脑脊液的确是采用了70%的概率。我们这样做，没什么文献支持，实际上，文献中很不统一。灰质采用50%、白质采用90%、CSF采用70%，仅仅是通过肉眼观察确定的，标准是在尽量保证代表所选择的组织的同时，尽量减小个体之间不同组织的重叠。
 
6.是的。

Submitted by demonpupil on Sun, 08/15/2010 - 11:11

臧老师好：
  一共是三个被试，数据采用的是今年去成都培训的人回来提供的数据。