关于分割配准的问题

我使用dparsf进行ALFF的处理,跑完程序之后发现11个被试中有两个的分割结果不好,灰白质和脑脊液没有分离开,是模糊的,再看他们的功能像配准也有问题。由于之前做过VBM分析,当时是直接用spm分割的,相同的被试分割效果很好(详见下图)。回想起来,中间不同的是进行resting分析的时候多了结构像和功能像coregister这一步,想请教一下为什么这一步会带来这么大的变化呢,对于这两个被试resting图像的配准有什么其他的处理办法吗(如果还是想用分割配准)。

   C1 with coregisteration                   c2 with coregisteration              c1 without coregisteration           c2 without coregisteration
   

谢谢!

谢谢臧老师回复!
上面经过coregister的分割图是直接从dparsf处理过后的T1ImgSegment文件夹中copy出来的。我之后又参照视频中的讲解,手动用spm跑了一遍,coregister过程中,target是mean*.img,source是T1.img。然后再进行分割,出来的结果和上图是一样的。下面是coregister出来的图。

Hi!
一般来说coregister是不会影响分割效果的。
在DPARSF中,coregister只是改一下头文件中的affine矩阵,使得让结构像的朝向与功能向一致,而不修改数据文件本身的。
一个可能的原因是你的功能像朝向太偏,导致后面unified segmentation不能很好的进行。
你可以试一下DPARSF Advanced Edition中的Reoreient Interactively功能,在Coregister之后,再手动把图像摆正一些,有更好的分割效果。具体做法见:http://www.restfmri.net/forum/Course

Thanks a lot! I've tried the reorient function. The results are pretty good!

Cheers!

Hi!
Thanks for your report!
Acctually, the module of "Reoreient Interactively" is designed for this situation. If you the images has a bad orientation, you can use this module before normalization or segmentation.