AAL time courses没有变量名，即90个脑区的名称

Submitted by Fmri-networks on Sat, 05/07/2011 - 09:26

问题1：
DPARSF's standard processing steps:
12. Extract AAL or ROI time courses for further analysis (optional).
对一些数据提取时间序列后，得到的90个时间序列的变量名为AAL??TC如下
AAL62TC: [125x1 double]
尽管可以做初步的功能网络分析，但是不利于后面结合脑神经精神文献和数据进行生物学意义上的讨论。
因此能不能在软件中给出一个AAL??TC与具体的脑区名称相对应的表格。

问题2：
能不能在DPARSF中设计提取所有体素voxels的时间系列？（同时体素的大小可以自定义，以便根据实际的计算能力来决定voxel的数目。）

十分感谢严博！

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 05/07/2011 - 10:08

你好！
1. 关于各AAL脑区对应的名称，请见：http://www.restfmri.net/forum/DPARSF_V1_0#comment-373
2. 提取所有体素的时间序列？这个不用提取，直接读进来就可以，比如用rest_to4d。
如果说你是要提取一个MASK文件中包含不同的区域label，则请下载最新的REST，在Extract ROI Signals里面新增了这个功能。

Submitted by Fmri-networks on Sat, 05/07/2011 - 21:04

好的，十分感谢！
对了，各AAL脑区对应的名称列表中的x,y,z 以及X Y Z (mm) 这些坐标有什么样的关系公式？

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 05/12/2011 - 20:48

你好！
X Y Z (mm)和x,y,z 代表某AAL脑区重心的MNI坐标以及体素index。

Submitted by 风清云淡 on Fri, 12/07/2012 - 21:06

 怎么用marsbar-aal获得脑区，我是个菜鸟，请多多帮助，不胜感激

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 12/08/2012 - 04:08

你好。marsbar我没怎么用过，可能有其他研究者会来回答这个问题。你用REST也可以提取AAL的时间序列。