求助VMHC的一个问题

Submitted by liufeng on Fri, 09/14/2012 - 00:02

大家好，最近我打算用rest试着跑VMHC，出现以下问题：

我直接打开rest的，然后输入数据目录，提示没数据。
我不知道做VHMC需要哪步的数据，我试过这些目录的数据，都提示no data：
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFiltered
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

应该选择哪一步的数据呢？

谢谢

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 09/15/2012 - 00:49

VMHC原理与功能连接(seed based correlation)差不多。所以两者应该用相似的预处理。即FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

如果你是选择上面的总文件夹的话，需要点右键“Add recursively all sub-folders of a directory”来添加。

Submitted by Chen0075 on Sat, 02/23/2013 - 00:33

 您好！
我对VMHC也感兴趣，读了几篇文献发现都是基于FSL/Alfani做的，我们的新版Deparsf是否能够全程跑完。
1）跑到FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved，是否表示预处理完成了。接下来再选择“Normalize  to symmetric template” 和“VMHC”即可？
2）新版里“Normalize derivative” 和“smooth derivative” 是用来干什么的，要选择吗？
3）文献里VMHC的统计比较似乎也和我们平时用的不一样，能够用rest里面的FDR/Montcarlo矫正吗
谢谢！


Submitted by YAN Chao-Gan on Sun, 02/24/2013 - 16:49

Hi,

1. 预处理步骤是完成了，这是一种比较常见的方式，当然争议还是存在。如果你是用basic edition处理的，然后再advanced edition做normalize to symmetric template，不一定能正确地找到文件，但你可以试试。

2. normalize derivative是在原始空间计算之后，把计算出来的指标（如ALFF）配到MNI空间。smooth同理。

3. 我认为在一侧MASK里面是可以的。

Submitted by Jianglan on Mon, 07/08/2019 - 22:40

严老师好，这两天用DPARSF计算VMHC老是报错，看过了视频和论坛，还是没有找到答案，希望得到您的指导！

1.怕是数据有问题，我跑了两遍，每次都到computing VMHC出现问题，说File doesn't exist: F:\my_fmri_data_hangzhou\123\FunImgARglobalCWFsymS\pat_001_A_01.nii.gz（两次说的不存在的被试对象还不一样），报错的红字我附在附件txt中，自己查看了下，这个文件夹中，pat_001不像其他被试，他是单独的一个文件，其他的都有文件夹，感觉他就像没被处理一样
2.Results中有两个文件夹，VMHC_FunImgARCWFsymS 和 VMHC_FunImgARglobalCWFsymS ，我该看哪一个呢？具体的含义是什么？