post-hoc t-test

老师:
     您好!
     1.我有三组被试,先做了ANOVA, 得到了ANOVA显著的clusters, 然后save clusters做为mask,在这个mask里做two-sample post-hoc t-test.  用AlphaSim进行多重比较校正,那voxel level p值和 相应的cluster size是怎么定的呢(Alphasim矫正后的P为0.05 )?
     2.我研究的是Reho, 审稿人提出要控制灰质、白质混杂因素,在两组之间比较时,我已经把灰质体积加入了协变量,白质是否也可作为协变量加入,是否有比较方便的工具量化白质呢?
     3.三组被试的人数需要完全一致吗?如果不一致的话,在数据分析的时候需要特别处理吗?

     谢谢!  
  annie

1、可以这样做。Alphasim阈值的选择,请详细看一下Alphasim的使用。但需要注意的是,目前的软件并没有提供两两比较的多重比较校正(这儿,有三组共三次比较),这样会增加假阳性。比较严格的方法是采用Bonferroni(除以3)。
2、我认为即使灰质为协变量也应该慎重,没有证据显示灰质与ReHo是线性关系。比较严谨的做法,应该把加和不加协变量的结果都报告一下。
3、三组被试不一样,应该也是可以的。但好像有的ANOVA模型不支持(记得AFNI只支持三组相同)。如果不支持,只能使三组的样本一样。

 谢谢老师,1.如果不用anova,用multiple two-sample t-tests 进行两两比较的方法妥当吗?
               2.比较时把头动(FD)作为协变量,是否更好?

1、直接采用两两比较,如果严格进行多重比较校正(不仅仅是校正多个体素,还要校正多次t-test),应该也是可以的。
2、加协变量总得来说是好的,但我个人一直推荐加和不加协变量的结果都报告,而不是只报告去协就是的结果。