REST Alphasim P值

 
REST1.8界面上有个输入p值的地方,在这之前,我做了AlphaSim校正,
 
这个p是做alphasim校正时候填写的individual p value(比如p=0.01或者0.005) ?还是最后看组分析结果时候的p value (比如p<0.05)?

“REST1.8界面上有个输入p值的地方,在这之前,我做了AlphaSim校正”

你指的是哪个界面? viewer吗?

viewer界面的P值位置,是individual P value。你跑完Alphasim后的P(文本文档里的)是校正后的P

Alphasim校正后的p值在文本文档里吗? 哪一个是?

下面是文档内的内容

 

Cl Size Frequency   Cum Prop    p/Voxel Max Freq    Alpha

1       14018       0.942703    0.009700    422     1.000000

2       767       0.994284      0.001105    495     0.578000

3       73         0.999193     0.000164    71     0.083000

4       11         0.999933    0.000030      11     0.012000

5       1          1.000000    0.000003       1     0.001000

谢谢您的耐心回复!最后两个个问题:

1.文档最后一栏里,第一个小于0.05的P值是0.012,那么这个0.012P值有什么作用,是在报道的时候用,还是什么时候用?

2.REST viewer里面的p值,刚开始我填的是individual p值 0.05 ,那么alphasim校正完后,我是否应该将此p值修改为0.012还是继续保留0.05的值?

 

文章里两个P值都要报,0.012就是校正后的P值是0.012.

individual p值是每个voxel的p

因为同时做了很多次统计,voxel by voxel 所以需要使用多重比较校正。

我这样理解 看看对不对

在进行alphasim校正的时候 操作步骤如下:

Individual P = 0.005, iteration = 1000, rmm=5, mask 选择为MASK,生成*.txt文档

在文档中,寻找p <0.05的阈值,得到p=0.012,对应cluster size为4

在Viewer中,填写P = 0.005,在cluster size里面填写4 ,在Slice Viewer界面中,得到T= 2.89

在文章results中,报道如下:

(Alphasim correction, the corresponding statistical level is set at |Z| >2.89 (p<0.001 at individual voxel level) and cluster size >4 voxels (search volume = 12569 voxels)), which corresponds to a corrected p<0.05.

 

我的问题:

1. 在Viewer中,填写P = 0.005(individual p value),还是p= 0.012还是p=0.05?

2.在英文的结果报道中,最后的p<0..05还是写p=0.012?

|Z| >2.89    是t值

cluster size >4 voxels  这里你可以标注一下立方毫米,以及rmm。

在viewer中,p填写 0.005,。

英文结果报告中,都要写,但是你校正后的值是 P<0.05 corrected.