关于fALFF的计算分析

老师,您好!我最近在做分频段的ALFF和fALFF分析,在计算fALFF时,我对一些参数的设置不确定。

比如我想做0.01-0.027频段的fALFF分析,我在Input Parameters里输入的是不是经过0.01-0.027Hz滤波后的文件(像做ALFF一样)?还是做完去线性漂移(detrend)后的文件?

注:Option:Ideal Band Pass Filter 这一栏之所以没设,是因为我已经做完了0.01—0.027 Hz的滤波。

还有Band Hint 这一栏是不是也要设置为0.01—0.027(如下图)?其他参数设置有什么要注意的吗?

Re: 关于fALFF的计算分析

这个问题我倒是没有太注意。不过最方便的还是在DPARSFA里面做更好一些,直接在ALFF计算旁边的那个filter选项选择相应的亚频段就可以,注意之前不要进行滤波~

Re: 关于fALFF的计算分析

老师,您好!我用gretna做了预处理,做到平滑后的这一步,生成的被试文件有前缀swran,比如AD组:swran30001,swran30002,swran3003...,我把它们每个被试放在一个文件夹里,命名:30001,30002,30003...,再把AD组的这些被试的文件夹放在一个文件夹里并命名:FunImgNormalizedSmoothed,现在我想用dparsf计算fALFF,可是在Working Directory 那步就读不进去,Participants那里啥都没有,会出现如下图:

(1)应该怎么处理?还是gretna做预处理的平滑后的文件不能用dparsf做后续处理,还是我文件名的命名格式有错?

(2)我想计算0.01-0.027 Hz的fALFF,Detrend后面的Filter还要不要设置,如果设置,设置啥?(如下图)

(3)如果我再勾选Extract ROI time courses,产生的结果是啥?

不好意思老师,问题有点多,麻烦您了!

Re: 关于fALFF的计算分析

(1)应该怎么处理?还是gretna做预处理的平滑后的文件不能用dparsf做后续处理,还是我文件名的命名格式有错?
re:用dparsfa来做剩下的处理,basic edition不太灵活、这种情况下不容易导入数据;例如将ad001.nii的4d文件放在单独的文件夹,每一个都如此,最后给这些文件夹套上一个总文件夹,那个总文件夹就可以作为dparsfa数据的输入入口(右下角框内);
(2)我想计算0.01-0.027 Hz的fALFF,Detrend后面的Filter还要不要设置,如果设置,设置啥?(如下图)
re:dparsfa版本在detrend后面有filter选项,这里选择相应频段就可以;
(3)如果我再勾选Extract ROI time courses,产生的结果是啥?
re:这里是抽取ROI内的时间序列及相关系数矩阵(取决于ROI如何选取)。

Re: 关于fALFF的计算分析

谢谢老师的详细解答!

可是我按照您说的做,每个被试的4d文件放在一个单独的文件夹,最后给这些文件夹套上一个总文件夹,在Working Directory那读入,可Participants窗口仍啥也没有,如下图所示:

(1)不知道为什么还读不进去?(我用的matab是2010a版本的,而且没有报错)

(2)另:“那个总文件夹就可以作为dparsfa数据的输入入口(右下角框内)”,右下角框是Starting Directory Name 吗?它一直显示FunRaw,没有变,需要我手动改吗?

(3)不知道Other covariates后的滤波Filter与ALFF+fALFF之后的滤波有啥区别?两者不能同时勾选,是不是一个在计算ALFF,fALFF之前滤波,一个在计算之后滤波?

那我要计算0.01—0.027 Hz的fALFF,是不是要勾选detrend后面的滤波选项?(如下图)

(4)我理解的fALFF是要计算的频段的能量除以全频段的能量,可是这里全频段的能量体现在哪啊?

 

Re: 关于fALFF的计算分析

(1)这个ARWSD文件夹之上还要套一个总文件夹,作为working directory才能导入;

(2)需要手动改,比如复制上面文件夹名、粘贴替换默认的funraw,回车就可以;

(3)对的,选择之后那个;

(4)这个你不用担心,会自动计算的。

另外有一个突出的问题,如果用其它软件做的预处理,回归协变量那一步一定要充分,因为再返回到dparsfa里面做就变得复杂、容易出错了。

Re: 关于fALFF的计算分析

谢谢老师的详细解答!

Re: 关于fALFF的计算分析

好的,谢谢老师!

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