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本周二(2011.11.29)组会通知

本周二继续文献报告:
报告的文献为:《Reducing inter-subject anatomical variation: Effect of normalization method on sensitivity of functional magnetic resonance imaging data analysis in auditory cortex and the superior temporal region》。
这篇文献主要内容:SPM2-normalization,SPM5-统一分割,SPM5-DARTEL,HAMMER四种配准方法对任务fMRI激活结果的影响,同时也考察了不同配准模板(ICBM152,Colin27,ICBM453)对配准结果的影响及不同配准算法下平滑和不平滑激活结果的差异。详见附件。

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本周二文献报告

本周二(2011.11.01)组会报告文献题目为:Functional connectivity in resting-state fMRI Is linear correlation sufficient(详见附件)。
时间:周二晚七点
地点:杭州师范大学附属医院7号楼2层读片室
欢迎大家参加。

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臧玉峰课题组 组会通知

臧玉峰课题组每周二晚7:00为文献报告组会,会上将撷取静息态功能磁共振相关领域的经典文献进行详细报告和讨论,本组会将对外开放。

每次组会前一天(周一),我们会将报告的文献以及会议地点在本网站上通知,敬请留意。

如果您对此感兴趣,或者希望与课题组更广泛的交流和合作,欢迎按通知的时间地点来我组参与讨论,如果您不方便来杭州,我们也可安排和组织,以网络会议的形式开展。请联系课题组秘书贾文斌(e-mail:wenbinjia.08@gmail.com), 欢迎您的参与。

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学术报告信息

学术报告

1. 认知障碍的影像学检查

报告人:首都医科大学宣武医院神经内科 韩璎 博士

2. 社会老年人神经心理学测查与脑结构磁共振研究

报告人:School of Psychiatry, University of New South Wales,张浩波 博士研究生

时间:2011年10月22日9:00
地点:杭州师范大学附属医院七号楼二楼读片室

主持人:杭州师范大学认知与脑疾病研究中心 臧玉峰 教授

欢迎光临!

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关于如何把DTI数据导入spm8预处理后再导到DTIStudio里计算

老师,您好!由于一直以来我在DTIStudio软件里,经过它的ARI之后,就直接计算和friber tracking,出来的图不清晰,fiber也很不理想。据说你有说过可以先把dti数据在spm中预处理后,在导到DTIStudio,我错过了你说的这个内容。
请问老师可以告诉我这个处理,具体怎么做吗?谢谢

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New Bug Report -regarding reslice timing

各位好:
今日用DPARSF中的步骤处理task数据(滤波以前所有步骤),数据扫描的时候TR=2.

在处理数据的时候,软件自动报出‘Your TR is 1.8'。同一批数据,还出现了‘Your TR is 1.9'的情况,但是用mricro查看dicom转换为hdr/img的参数,仍然显示TR=2。

请问这是什么情况?

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关于caret为什么不能正常叠加激活图

严老师
你好
在你上次教了我们如何使用CARET之后,我就一直想尝试使用它,但是一直没有成功。我按照你们网页上介绍的把caret_distribution_Linux32.v5.64、那个TUTORIAL文件夹、以及两个你为我们做好的.spec,.scene文件,并把WINDOWS的区域语言选项中高级项的UICODE选为英文之后重启。CARET文件可以打开,我按照你所讲的步骤一步一步地把激活结果文件叠加到大脑表面结构上,但是无论我选择任何按键,我的激活图始终显示不出来。甚至,我还下载了LINUX版的在LINUX系统下也安装运行过,都存在一样的问题。 我不知道这是为什么?请指教。谢谢。

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SPM一运行estimate就会出现out of memory的问题

各位,
我初学SPM,遇到了两个问题,还望指教
1、DICOM图像经过SPM分割后生成.img格式文件,但我将该数据利用matlab进行了一项处理(SPM没有的)。所以,这时我的数据是.mat格式的了。
通过在网上查到的save_nii.m文件,的确可以将.mat格式的文件转换成analyze格式。但是数据量却剧增。分割后的数据大约30M,而转换后的数据却达到了150M。
即便是我将.img格式文件读入到matlab,不经过任何处理,通过save_nii.m保存,数据也达到了150M。
不知谁遇到过这种问题,如何解决?

2、目前,我有一套数据,176*448*512
SPM一运行estimate就会出现out of memory的问题

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关于srestliceviewer的色阶设置

restsliceviewer的色阶可以采用类似Afni的色阶表现,也可以采用spm的色阶表现,但是均是给出一个下限,范围是[-∞,-下限] and [下限,+∞],但是在一些标准化数据后显示,我希望看到小于-6,-5到-4,-4到-3,-3到-2,2到3,3到4,4到5,5等6及大于6这样的色阶表示方法,不知道能不能通过修改程序,增加参数实现?

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