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DTI模板(请教严老师)

严老师:
    

       请问您在进行DIT空间标准化时用的是T1图还是T2图,因为DTI 扫描时用T2*,因此是不是配准时必须用T2模板,如何您有T2模板,是否可以上传一个?用何种软件下配准?可以DPARSF的模块吗?

        我们遇到一个难题,之前的配准选了一个Control,结果无法进行定位,只能肉眼测定解剖结构。
        

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AlphaSim校正的问题

老师你好,我想请教的问题如下:
1. 为什么在脑的研究里,alphasim校正比FDR,FWE更合适?
2. alphasim校正时,选择不同的cluster size和p值结果会有明显的不同,我们如何知道选什么样的cluster size和p值才是合适的呢?选择p<0.001的脑区里却有着不属于p<0.005的脑区,我们如何解释这一现象呢?
3. 用alphasim校正时,我们在文章里除了报告p值外还要报告rmm的值和使用的mask吗?还有其他的吗?

非常感谢!

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small word, GCA用什么软件做,怎么操作

各位老师好:
最近看了一些关于GCA与small-word的文献,觉得太有意思了,想自己做做预实验看看结果,但是文献中报道的方法我不清楚应该用什么样的软件又如何一步一步的完成,各位老师能否推荐一下能做这两种研究的数据处理软件,以及指导进行这两种研究数据如理的Mannual或者视频等等。感激不尽啊!!

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如何查看xjview的结果?

请教一下,做组块时,查看脑区激活,在xjview中如何分析?
例如一下的一个cluster该如何分析?
Cluster 1
Number of voxels: 149
Peak MNI coordinate: 45 -63 -36
Peak MNI coordinate region: // Right Cerebellum // Cerebellum Posterior Lobe // Tuber // undefined // undefined // Cerebelum_Crus1_R (aal)
Peak intensity: 3.7961
# voxels structure
149 --TOTAL # VOXELS--
149 Right Cerebellum
149 Cerebellum Posterior Lobe

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招聘

杭州师范大学认知与脑疾病研究中心与杭师大附属医院联合招聘影像专业医生及科研人员(详见附件一)和精神病学医生及科研人员(详见附件二),并为各级人员提供一流的科研设备以和一流的个人待遇。

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本周二(2011.12.13)组会

本周二继续文献报告:Reducing inter-subject anatomical variation: Effect of normalization method on sensitivity of functional magnetic resonance imaging data analysis in auditory cortex and the superior temporal region。
这篇文献和上周是同一篇文献,主要内容为:SPM2-normalization,SPM5-unified segmentation,SPM5-DARTEL,HAMMER四种配准方法对听觉任务fMRI激活结果的影响,同时也考察了不同配准模板(ICBM152,Colin27,ICBM453)对配准结果的影响及不同配准算法下平滑和不平滑激活结果的差异。
具体文献下载请见上次的通知。

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本周二(12月6日)组会

本周二汇报的文献:Reducing inter-subject anatomical variation: Effect of normalization method on sensitivity of functional magnetic resonance imaging data analysis in auditory cortex and the superior temporal region,详见附件。
这篇文献主要内容:SPM2-normalization,SPM5-unified segmentation,SPM5-DARTEL,HAMMER四种配准方法对听觉任务fMRI激活结果的影响,同时也考察了不同配准模板(ICBM152,Colin27,ICBM453)对配准结果的影响及不同配准算法下平滑和不平滑激活结果的差异。

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