ZangYF Group's CVs

GMV与GMD的关系：一个有趣的案例

Submitted by Authenty on Mon, 11/04/2013 - 12:14

各位老师：

GMD图像保留着单个体素内的原始MR信号强度，代表GM的相对量，即在给定voxel(s) 内相对其他组织，GM在某个区域内所占的比重；
GMV图像是GMD乘以Jacobian空间转换矩阵的行列式，代表GM的绝对量，即GM在绝对数量上的多少；

在我的数据中，我们发现了一个非常有趣的现象：在脑区1中，GMD与行为变量A负相关（neg），但是GMV却与行为变量表现出正相关（pos），且二者都经过了多重矫正；在脑区2中，GMV和GMD都与行为变量A正相关。请问，该如何解释？

多谢各位老师！
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note: 我们目前的解释——在脑区1中，更多突触联系导致GMV的提高，外在表现为A的水平提高；但是，更多突触联系也带来更多相辅助的白质WM的增加，并且，WM增加的速度可能快于GM增加的速度，从而表现出GM相对比重的下降；而在脑区2中，WM增加的速度不大于GM增加的速度，从而随着GM绝对量（GMV）的增加，其相对量（GMD）也随着增加。

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dparsf (A) 原始空间计算

Submitted by zhoujun on Mon, 11/04/2013 - 20:41

 老师您好：

       我现在有个疑问，我按照原始空间计算的步骤来，最后normalize和smooth，但是发现FunImgARCF_ROISignals是在 normalize和smooth之前出来的，我和传统顺序对比了下，还是有差异的，没有 normalize的话，提取的信号准吗？哪种结果比较好？

谢谢

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请问使用vbm做数据预处理的正确做法

Submitted by kobejuan on Wed, 11/06/2013 - 13:30

各位老师大家好，我最近在学习使用vbm8进行T1结构像数据处理，一共有两组数据（一组病人给予药物干预，一组不给予干预。每组病人都进行了干预前和干预后的磁共振扫描）。我想咨询下老师，纵向数据预处理是运用vbm8手册上的下面这1步同时处理每个病人的干预前后两个时点数据就可以了吗？还是要每个病人的两个时点数据分开处理（第一步estimate and write,  第二步smooth)?谢谢

 
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mica出错

Submitted by szjoanna7 on Wed, 11/06/2013 - 18:48

各位老师好，我正在用mica处理数据，在70%的时候出错如下，已经生成了保存个体成分的Mat文件，没有生成Output文件夹，想问问各位老师是什么原因。谢谢！

Aggregating agg component
Aggregating agg component #1

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ROI-wise FC analysis in REST: individual covariate scores

Submitted by Mamtis13 on Thu, 11/07/2013 - 01:15

Dear experts,

I have conducted a ROI-wise (i.e. 2 ROIs) functional connectivity analysis in REST. To start with, I only ran the FC analysis for each subject, but now I would also like to include a personality score for every person. How can I include the parametric covariate, which is different for every person in the ROI-wise FC analysis in REST?

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关于FC统计的问题

Submitted by present_s on Thu, 11/07/2013 - 10:20

 老师：
      您好
      我想请问一下
      我用DPARSF做患者与正常对照组的ROI－wise FC分析时，定义了4个ROI，得到4组zROI1FCMAP...zROInFCMAP,这些map指的是某一个ROI与全脑所做的FC分析吗？
     
      如果我想做患者与对照组的two-sample t-test时，是应该把这4组map放在一个文件夹里，还是把每一组的map分开放在4个文件夹里进行双样本的统计呢？
     

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请教rest做协方差分析时去协变量的问题？

Submitted by LiangHong on Thu, 11/07/2013 - 11:43

您好！
     四组被试用rest做ANCOVA，性别年龄做协变量，请问去除协变量时，是每组被试各自去除完该组对应的性别年龄协变量之后进行方差分析，还是四组被试一起去除性别年龄协变量之后进行方差分析？
    谢谢

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DPARSFA报错。

Submitted by rest_yan547833397 on Fri, 11/08/2013 - 10:50

严老师：
      您好，我最近用DPARSFA跑数据是，出现错误。这个Converting Functional Images:OK，但是FunImg没有相应的文件生成，这是为什么呢？
       然后我用以前的FunImg跑后面的slice timing的时候出现一下错误：
Error using movefile
Error in DPARSFA_run (line 405)

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VBM和问卷相关

Submitted by snowgirl on Fri, 11/08/2013 - 14:07

 现在有两组数据，一组病人的，一组控制组，我想做的是两组的灰质体积在某一问卷上是否有差异。现在的思路是用两样本T检验得到两组有差异的脑区，然后提取出各个有差异的cluster的体积，再与相应的问卷的得分做相关。不知道是否可行？先谢谢各位的回复。

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