October 2012

Reference to non-existent field 'FunctionalSessionNumber的问题

Submitted by zhenyu_Jia on Wed, 10/17/2012 - 23:09

老师您好，我是初学fMRI的，目前遇到的问题是：当我运行DPARSF basic edition处理从您的网站提供的联系数据的时候，勾选好选项点击RUN就直接出现下面的代码，当运行advanced edition的时候就不会出现，请问这是什么情况？谢谢！

??? Reference to non-existent field 'FunctionalSessionNumber'.

Error in ==> DPARSF_run at 240
for iFunSession=1:AutoDataProcessParameter.FunctionalSessionNumber

Error in ==> DPARSF>pushbuttonRun_Callback at 989
[Error]=DPARSF_run(handles.Cfg);

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Resting-state fMRI topics

请教各位老师关于ReHo two-sample T 统计校正的问题

Submitted by wujingxi on Tue, 10/16/2012 - 18:19

刚刚综述完ReHo的文章，发现似乎在two-sample t中，很少有FWE校正的结果，有一下几个问题：
1.对于two-sample t，很少有文章报道FWE校正的结果，请问这是为什么？是ReHo算法本身使得导致的还是数据一致性不高导致的？
2. 有没有人发现FWE校正后仍然有结果survive出现的情况？
3. 如果在全脑范围内没有FWE校正的结果，能不能在有差异的区域之内利用FWE采取small volume correction进行校正呢？

谢谢

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Resting-state fMRI topics

请教严老师有关如何整理rest sliceviewer 中cl reports 文档，脑区该如何选择？

Submitted by shenghui on Mon, 10/15/2012 - 21:18

严老师：你好，我是用dparsf预处理的数据，rest 做的统计分析，现在统计的图片和cl report都出来了，就是不太明白如何整理cl report中的结果，生成发表文章的报表形式，我做的是癫痫患者和病人的双样本T检验，MASK是并集MASK，做过AlphaSim 校正，增强的Clusters 有26个，减弱的有15个，这些体素都要报告吗，是不是有点多啊？

还有每个Peak点对应的脑区该如何选择啊，是选择voxel structures 中较大的相对具体的脑区，还是peak MNI coordinate 中的比较具体的脑区，如果两者不一致的情况下该如何选择，有几个差不多大的较大的脑区是都要报告出来吗？

还有一个问题不明白，不是经过AlphaSim（>55个体素）校正了吗，为什么活下来的clusters中还有很多是小于55的也在cl reports中显示出来了啊？

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SPM8数据分析中，neurological convention和radiological convention的问题

Submitted by Red Stone on Mon, 10/15/2012 - 20:57

各位老师好：

我有一个spm8数据预处理的问题，想请教各位老师，还望不吝赐教。

我现在使用SPM8对fMRI数据进行数据预处理，是跟师兄学的处理方法，流程如下：从医院采集到radiological convention的数据；然后用MRIcro人为地对数据进行左右脑的flip，得到neurological convention的数据；然后把neurological convention数据导入spm8中，进行预处理。

可是最近，从网上的一些spm8的论坛里看到，说是spm8在处理数据的时候，会自动进行左右脑的flip，因此，只需要将医院采集得到的radiological convention数据直接导入spm8就可以了。如果真是这样，我以前分析的数据，左右脑岂不是都反了？

很希望各位老师能为我解惑。谢谢！

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