严老师：
您好！
我是一位初学者，现在想基于ROI做工能连接，要选择AAL模板上的90个脑区，但不知道怎样定义ROI，可否麻烦老师把详细过程给我说下？非常感谢！
严老师：
您好！
我是一位初学者，我想基于ROI做工能连接，要选择AAL模板上的90个脑区，但不知道怎样定义ROI，可否麻烦老师把详细过程给我说下？非常感谢！
there are two major methods commonly applied in resting-state fMRI,such as seed-based correlation analysis (SCA) and independent components(ICN).in REST of course FC is the first kind.but i am not sure about the Reho,fALFF,and VMHC.i am preparing an article about the subtle difference among those methods in REST while analyse the same data.thanks!
老师您好
我想请问一下功能连接的Z值的问题：
1、例如AD-NC双样本T检验在某个CLUSTER上t值为正值，说明AD比NC增强的正连接、或者降低的负连接，我怎么分别确定AD和NC的连接性质，是把坐标回输到AD和NC各自的单样本T检验去看吗？
2、组内的单样本T检验的正z值说明功能连接是正连接、负Z值说明功能连接是负连接吗？
3、如何获得在这个有显著差异团块的平均Z值？我用团块的peak点坐标分别回输到AD组和NC组的单样本T检验图像里，这样得到两组分别的Z值与用保存cluster制作mask提取各组Z值的平均值不一致，请问这两种方法得到的Z值有什么区别？
i have seen the course online about how to use the REST for FC,but how to get a negitive correlated network?must be different with the positive FC .i want to know the accurate steps.thanks
大家好：
严老师，
您好！
我是首都医科大学宣武医院的研究生。我现在在做帕金森病认知障碍的脑功能连接的研究。用的是您的DPARSF来处理数据。
我的第一批数据按您的教程顺利做完了。但是第二批数据则老出错。我尝试了重新装软件等，但总是有这样那样的问题，但我都看不懂。
最多的错误如下：
Removing the linear trend: E:
Read 3D EPI functional images: "E:\Analysis\FunImgNormalizedSmoothed\PD27"..............................................
??? Error using ==> ctranspose
Out of memory. Type HELP MEMORY for your options.
Error in ==> rest_detrend at 40
DPARSFA has no problem processing a NIFTI dataset through the steps of Slice Timing and Realign. However, I get a reproducible error if I try to separate the steps in the pipeline. For example:
1) Processing the NIFTI dataset through Slice Timing alone works fine.
老师：
您好。我用VBM比较两组被试灰质差异，想用Alphasim进行校正。标准化后得到的图像voxel size为1*1*1。我有以下几个问题：
1、在用REST Alphasim计算时，mask应该用全脑的还是用灰质的？
2、如果选择灰质mask，是不是可以用spm/apriori中的灰质图，然后用rest中的image calculator，设定i1>0.2, 得到灰质mask后再重采样成1*1*1，这样制成的灰质mask是正确的吗？假如我做白质的分析，白质mask是不是可以直接对rest中提供的WhiteMask_09_61*73*61进行重采样？
3、在REST Alphasim计算时，由于voxel size为1*1*1，那么rmm是不是可以选择2？
请老师指教，谢谢！
我目前正在进行的课题需要分别提取全脑每个VOXEL的时间序列。我已使用dparsf完成原始数据的预处理，接下来应该怎么操作呢？
我在论坛中看到有人提到可以使用rest_to4d这个函数，
我在MATLAB中输入 rest_to4d(‘J:\Analysis\FunImg\sub1‘)
报错如下：
Read 3D EPI functional images: "J:\Analysis\FunImg\sub1"........................................??? Error using ==> rest_spm_slice_vol
File too small.
Error in ==> rest_spm_read_vols at 34
Y(:,:,p,i) = rest_spm_slice_vol(V(i),rest_spm_matrix([0 0 p]),V(i).dim(1:2),0);