January 2013

DPARSFA 出错

Matlab 2012a
Win2008 64bit
REST 1.8
DPARSFA 2.2

选项及操作内容见附件,我没有处理被试的T1图像,不知道在DPARSFA 中应该如何处理设置

Matlab 出错信息如下,多谢指教,谢谢!

Index exceeds matrix dimensions.

Error in y_Normalize_WriteToMNI_DARTEL (line 47)

各位老师,菜鸟请教一个功能连接图的问题

       本人想做一个关于耳鸣治疗前后的FC改变的图。根据文献(Maudoux, A., P. Lefebvre, et al. (2012). "Auditory resting-state network connectivity in tinnitus: a functional MRI study." PLoS One 7(5): e36222.)的23个ROI进行FC计算,得到相应的*ResultCorr.txt结果,使用brainnet工具可以生成单个对象的功能连接线图。请问如何得到治疗前后组的*ResultCorr以及经过配对T检验的*ResultCorr??以下是单个对象的线图

有关xjview

尊敬的各位老师:
       我把网上下的xjview的软件包解压到matlab的toolbox的文件夹下,可以在rest的软件打开report,但是在matlab的command的窗口中却不能打开,跳出如下图,请老师看看具体原因是什么啊?

补充一个校正问题

严老师:
   用rest1.8 sliceviewer中的一个校正问题。
我用alphasim校正(cluster size大于228,rmm=5),正负两个cluster有边相连,正cluster2021个voxels,而负的只有28个voxels也被保留下来了,而且归到正的cluster里了。请问这种情况是正常的吗,还是需要去掉那28个负的体素?

     祝好

使用rest1.8时候出现的一些问题

严老师:
   您好,我在使用rest1.8 sliceviewer时经常出现一些问题,想向您咨询一下。
1. 在服务器上用小键盘设定p值时经常出现乱码,而用大键盘时正常。
2. 校正后和校正前自动生成的Color bar是完全一样的,个人认为校正后的color bar 的top值和bottom值应该随着校正而改变。
3. color bar中两个色块中的整数代表的是上一个色块还是下一个色块,特别是map中的color值都是整数的时候,比如overlap,我发现有时候代表上一个色块,有时候代表下一个下一个色块。
     祝好

关于时间点time point 的填写问题

各位老师你们好,我是一名数据处理的新手,在预处理数据进行到detrend 这一步时想用dparsf软件处理,(因为时间点的问题前面都是只能用spm处理,在这一步spm总是报错);当我把输入数据到dparsf,出现以下提示:
如果使用spm,则报错以下内容:

z标准化的方法

各位老师好:

从文献中看到,做完ICA之后,如果想做T-test,就得把ICA得到的成分做个z标准化,我想请问一下,这个z标准化可以用什么软件实现?

GIFT的utilities里面有一项是Z-shift,用它可以实现吗?我看manual上是这么说的:

“Z-shift is used to center the image distribution to zero based on the peak of the distribution.”

这句话是什么意思?

还望各位老师能为我解惑,谢谢!

rest-gca

各位老师:
 我是刚接触rest-gca,对一些基本问题不太了解,希望得到老师们的指导:
 问题一:我对voxel wise和roi wise的理解和定义不太清楚,两者的具体含义是什么,
 问题二:必须有mask吗,gca就用时间序列分析不就行吗
 问题三:我运行时 Exception occured     subscripted assignment  dimension mismatch的问题怎么回事