January 2013

Question on setting parameters

Submitted by farras on Wed, 01/09/2013 - 01:10

In the following lines, what does SliceOrder refer to? is it the order of slices from the first slice to the total number of slices? And what is the role of ReferenceSlice?

AutoDataProcessParameter.SliceTiming.SliceOrder=[1:2:239,2:2:240]; % REVISIT.... was [1:2:25,1:2:24]
AutoDataProcessParameter.SliceTiming.ReferenceSlice=25;

With thanks,

farras

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AGE problems

Submitted by yhj2013 on Tue, 01/08/2013 - 23:02

各位老师好，
          学生是静息态的初学者，数据分析时遇到了一个问题，其实看起来是比较老的年龄问题，但是年龄确实是影响认知的因素，看了文章里一般都是年龄没有差异，或者是处理的时候回归掉让结果更加完美，但是如果不回归掉，在写文章的时候能否先回归得出结果然后再不回归的结果前后对比，如果差异不大则可以考虑暂时不计年龄的影响啊？是否需要这样说明一下？还是如果不进行调整的话做出来的结果可能不科学或者是不被认可？我试验中的年龄差异主要来源于其中两个组之间（一共三组被试），那我应该怎么做才能既不回避了年龄的因素，文章的统计方法上也没有错误呢？非常感谢！

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咨询一个Slice viewer和Xjview相同P值下T值不一样的情况

Submitted by liwenfu on Sun, 01/06/2013 - 20:41

老师您好：
请教一个在Slice viewer和Xjview中相同P值下T值不一样的情况：
我的数据是结构像数据，数据是1.5 X 1.5 X 1.5的，分析被试的灰质体积和问卷得分的相关，方法是在SPM中进行多元回归分析，得到的spmT_0001使用Xjview打开，设置p value=0.005，此时的T=2.8784，然后我使用Slice Viewer打开spmT_0001文件，设置p=0.005，此时的T=3.1966。两个软件输入相同的p值对应的T值不一致，不知道是什么原因。

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DPARSF outputs/results for second level analyses

Submitted by tsheng75 on Sat, 01/05/2013 - 08:02

 Hi guys,

I am a relatively new user of DPARSF/A and I am wondering which output/results files are the most appropriate to feed into second level group analyses? For example, does one use the 'ALFFmap', 'mALFFmap', or 'zALFFmap' files from each individual subject for a group-level t-test or regression? Some of the online documentation (albeit for previous versions of DPARSF) seem to suggest using the 'm' or 'z' files, but is that appropriate? In task-based fMRI, the con* images are fed into second level (and they are neither mean-normed nor z-scored). Please advise, thanks!

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请教关于DPARSFA_v2.2_Parallel Works报错问题

Submitted by fwd9707 on Fri, 01/04/2013 - 22:20

 我是6核电脑，运行dparsfa时调用4个CPU, 33个功能图像，再完成FunImg和T1Img转换以及去除10个时间点后，报错如下；盼老师予以解答，万分感谢！Configuration:

  Crash Decoding  : Disabled
  Default Encoding: GBK
  MATLAB Root     : C:\Program Files\MATLAB\R2012a
  MATLAB Version  : 7.14.0.739 (R2012a)
  Operating System: Microsoft Windows 7
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REST 软件相关分析

Submitted by moon on Fri, 01/04/2013 - 21:59

老师您好，根据视频中讲的，用REST Correlation Analysis,将功能连接图与一种评分做相关分析，得到R图，请问怎么从这个R图中得到结果呢？比如怎么看哪些脑区的连接强度与评分的相关具有显著性，以及得到这些脑区的信息。盼复，谢谢。

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请教一个关于做ALFF低频振幅全脑相关的问题

Submitted by liwenfu on Fri, 01/04/2013 - 14:30

老师好：
    我想将低频振幅的结果和一个问卷得分进行相关，看看是不是大脑自发活动和问卷得分有相关的脑区，方法是SPM中的多元回归，回归掉性别、年龄等因素，有下面几个问题：
      1、选择mALFF-1的数据是否妥当
      2、使用被试3D结构像分割后做成的被试最优灰质Mask作为数据分析的Explicit Mask是否妥当
      3、使用这个Mask从mALFF-1文件中提取每个被试的低频振幅值，作为协变量协变掉是否需要

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请教一个关于Alphasim矫正的问题

Submitted by duxue on Fri, 01/04/2013 - 11:18

       请问一下，在rest里面进行alphasim矫正时，如果是自己算，那么FWHM那个地方是按着预处理平滑盒大小来输的吗？比如预处理是8mm，那么这个地方是不是也是8呢？
       另外在选择mask的时候，能否将自己两组单样本的并集mask作为mask呢？（因为一般来说alphasim是基于先验假设进行的一种矫正方法，这个地方的mask应该选择自己假设中的mask，但这样选并集mask有没有问题呢？）
       最后，当我们在选择第一次出现小于0.05的时候，包不包括0.05呢？还是说必须是第一次出现小于0.05的值我们才要呢？
       非常谢谢~~~

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